里程碑小麦研究的资源可供下载

运用植物pre-site已经发布了第一个版本小麦基因组组装的简历。中国的春天,由TGAC生成的。这是最完整和准确的面包小麦基因组组装到目前为止总数的91%(98974个基因)基因组注释和组装——总序列长度13.4 gb。

比对RNA-seq数据从三个不同的研究在18个样品另外一直位于新组装。小麦基因组的数据可以通过基因标识符文本搜索的搜索框,或通过生物信息学爆炸(基本局部比对搜索工具)来比较序列匹配。进一步注释将逐步在即将到来的几个月。

新的和改良小麦组装将帮助小麦育种者加速作物改良计划和研究人员发现基因关键性状如产量、养分利用和面包制作质量。小麦是世界上最重要的农作物之一,新的基因组资源将帮助确保未来的粮食供应。公布的数据将是一个新的资源小麦研究人员和饲养者小麦倡议的建国原则基础上通过数据共享的协作来帮助解决全球挑战赛喂养2050年人口近100亿。

完整的数据集,确定基因,是公开从EMBL-EBI运用数据库。这是一个关键的里程碑BBSRC资助的研究项目“可持续农业Triticeae基因组学”与TGAC合作,JIC, EMBL-EBI和洛桑研究。序列的数据也可以搜索(爆炸)TGAC草根基因组平台。

发布的全小麦基因组数据集,项目领导Federica教授迪帕尔马TGAC科学主任,说:“这是一个了不起的成就,是那种TGAC的技术和科学的多学科人员能够交付。

迈克•贝文的约翰英纳斯中心(首席研究员),补充说:“这个新基因组大会使小麦新类型的研究因为它有精确远程信息的位置在大而复杂的基因组中基因和重复。我们的目标是促进世界范围内的工作人员通过释放组件处于初级阶段。”

TGAC由BBSRC和经营战略是国家能力促进基因组学和生物信息学的应用生物科学研究和创新。