分子网络识别潜在的自闭症谱系障碍
美国的研究人员已经发现了一个基因的分子网络,包括许多以前导致自闭症谱系障碍。研究结果提供的地图的一些关键的蛋白质相互作用导致自闭症和小说将有助于发现疾病的候选基因。结果发表在分子系统生物学。
“自闭症障碍的研究极具挑战性,由于大量的临床突变发生在数百种不同的人类基因与孤独症有关,”Michael Snyder说,斯坦福大学基因组学和个性化医学中心教授、该研究的第一作者。”因此,我们希望看到在多大程度上共享的分子途径多样化的摄动的突变与孤独症的蒸馏易处理的信息,将有利于将来的研究。”
研究人员生成他们interactome -整个细胞内设置的交互使用BioGrid蛋白质和基因相互作用的数据库。“我们已经确定了一个特定的模块在这个interactome组成119蛋白质和显示了很强的浓缩自闭症基因,”斯奈德。
基因表达数据和基因组测序被用来识别蛋白质交互模块与强烈丰富成员知道自闭症基因。25岁患者的基因组的测序证实自闭症模块的参与;自闭症的候选基因模块中还发现在一大群超过500患者被外显子组测序分析。基因的表达在模块检查使用的艾伦大脑图集。研究人员发现胼胝体的角色和少突细胞细胞在大脑中重要贡献者使用基因组测序自闭症谱系障碍,RNA序列,抗体染色和功能基因组的证据。
“今天的大部分研究自闭症是专注于研究神经元和现在我们的研究也显示,少突胶质细胞也与这种疾病,”李说晶晶,斯坦福大学博士后研究员基因和个性化医疗中心帮助带头工作。“在未来,我们需要研究不同类型的大脑细胞之间的相互作用或不同的大脑区域导致这种疾病。”
“丰富的模块我们确定了自闭症基因有两个不同的组件,”斯奈德说。“这些组件之一是表示在大脑的不同区域。第二部分在胼胝体增强分子表达。这两个组件的网络彼此交流广泛。”
科学家的工作假说,它与其他最近的发现是一致的,是胼胝体的中断部分干扰电路连接大脑的两个半球。这可能产生不同表型的自闭症,结果由于损伤大脑的两个部分之间的信号。
“我们的研究强调了建筑的重要性综合模型来研究复杂的人类疾病,”斯奈德说。“生物网络的使用允许我们添加自闭症临床突变到特定的疾病相关通路。这有助于发现针头在干草堆值得进一步研究和发现功能模型提供了一个框架,用于其他疾病。”
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出版
晶晶,Minyi史,Zhihai妈,Shuchun赵,图灵Euskirchen, Jennifer Ziskin Joachim Hallmayer, Michael Snyder亚历山大•城市。综合系统分析揭示了分子网络潜在的自闭症谱系障碍。分子系统生物学,2014年12月30日在线发表。doi: 10.15252 / msb.20145487
