老鼠基因组将有助于确定环境疾病的原因

15个鼠标菌株的DNA研究中常用生物医学的研究将帮助科学家们确定环境对疾病相关的基因。

身体现在公开的数据目录的遗传变异,显示数据作为鼠标单体型图,一个工具,将染色体在许多小段,帮助研究人员发现基因和基因变异的老鼠可能影响健康和疾病。

单体型图出现在7月29日的《自然》杂志是第一个发表全面的描述性分析的“老鼠基因组重测序和SNP发现项目”进行的国家环境健康科学研究所(NIEHS)的一部分美国国立卫生研究院的。

“这些数据让研究人员比较一个老鼠的基因组成应变,并执行必要的基因分析,以确定为什么一些人可能比另一个更容易感染疾病。这让我们更近一步了解个体易感性在人类环境毒素。我们也希望制药公司开发新的治疗环境疾病将找到这些数据,本文作为一种宝贵的资源,”大卫·a·施瓦兹说。医学博士NIEHS导演。

本文详细描述了费力和技术驱动的方法,用来确定827万年高质量的基因组单核苷酸多态性分布在15个鼠标菌株。单核苷酸多态性,或单核苷酸多态性(称为剪),是单基因变化,或者变化,可以发生在DNA序列。

大部分的项目是通过美国国家毒理学计划之间的合同NIEHS Perlegen科学,加州山景城的公司。

“老鼠基因变异的数据库应该促进各种重要的生物学研究的发展,并帮助演示这个数组技术方法的效用,”大卫·r·考克斯说,医学博士博士,首席科学官Perlegen科学有限公司

Perlegen科学家使用C57BL / 6 j第一个鼠标进行DNA测序作为他们的标准进行重排序四wild-derived和十一个经典鼠标菌株。寡核苷酸阵列技术,也被用来发现共同的DNA变异在人类基因组中。

数组看着大约14.9亿基地(58%)的25.7亿个碱基对的标准参考应变。数据被用来开发单体型图包含了40898段。

“数据将是一个宝贵的资源很多,包括美国国家毒理学计划,”施瓦兹说。国家毒理学规划处(NTP)中的是一个跨部门的项目,在NIEHS总部,与任务协调、行为和毒理学研究在美国政府沟通。

“国家结核控制规划是期待探索这些菌株的老鼠的反应各种环境因素,”约翰·布赫说博士,新的国家结核控制规划副主任。

弗兰克·m·约翰逊博士学位。,国家结核控制规划研究遗传学家和《自然》杂志论文的作者之一,补充说,更系统地描述鼠标菌株对毒素的敏感性与遗传分析不仅可以帮助,但是更好的职位人员的干预研究。

这些数据是公开在国家生物技术信息中心网站上http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/在Perlegen开发的一个网站http://mouse.perlegen.com研究人员可以下载个snp,基因型和LR-PCR引物对,目前映射到NCBI建立36。