产油微藻的NanDeSyn数据库将支持工业发展
工业产油微藻可以利用光能,把二氧化碳和水转化为大规模的油。因此,它是一个潜在的解决方案的可持续供应食物,营养和人类社会的燃料。
促进资源共享和合作,合成生物学和分子育种研究工业产油微藻单细胞中心领导的一个国际研究小组(SCC),青岛生物能源和生物处理技术研究所(QIBEBT)中国科学院(CAS),发布了“NanDeSyn数据库”。这项工作发表在植物杂志10月25日。
Nannochloropsis种虫害是工业微藻生长在户外大规模生产油。他们极具吸引力的特性为“光合酵母”,比如一个单倍体核基因组的碱基对~ 30米,简单和可靠的DNA转换、基因编辑效率高,且灵活的基因表达调控技术。
全球Nannochloropsis研究界已经积累了大量的功能基因组学数据,以及遗传资源,如质粒和突变株。
“NanDeSyn数据库”,由龚花城,et al .,鳞状细胞癌,南Kyu Kang et al .,从韩国先进科学技术研究所(韩科院),系统地收集和整合功能基因组和表观遗传学数据包括最新的基因组序列,基因注释,转录组、蛋白质组和小rna的Nannochloropsis物种。
同时,网上搜索,数据挖掘工具,如基因的基因组比较,共线性分析,基因富集分析,代谢途径分析,基因组浏览器是通过网站提供的。此外,结合文献研究,每个基因的研究现状,以及相应的向量和突变株,显示,以促进自由分享这些研究材料。
参考:龚Y,康NK, Kim YU, et al . Nannochloropsis NanDeSyn数据库系统和合成生物学。植物J。2020年。doi:10.1111 / tpj.15025
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