印第安人的祖先与表皮生长因子受体突变增加有关

底线:拉丁美洲的肺癌患者中,基因和血统分析表明,印第安人的祖先与表皮生长因子受体基因突变的可能性增加,吸烟的独立地位。

期刊的研究发表:癌症的发现,美国癌症研究协会杂志》上

作者:马修·安德森医学博士,癌症基因组学中心主任在波士顿丹娜-法伯癌症研究所;丹娜-法伯癌症研究所的遗传学和医学教授和哈佛大学医学院;和一个研究所的成员广泛的麻省理工学院和哈佛剑桥,麻萨诸塞州

背景:“肺癌是癌症死亡率的主要原因,在美国和全球范围内,和理解继承了这种疾病的风险因素可以帮助我们确定数量,将受益于增加筛查工作,”安德森说。

“以前的研究已经证明EGFR-mutant肺癌的人群中更普遍从东亚与来自北美或欧洲的人口相比,约50%与10%的肺癌病例,分别,”安德森说。”,但尚不清楚是否种族差异EGFR-mutant肺癌是由于环境或遗传因素,”他补充道。

在研究过程和结果:安德森和他的同事分析了1153例肺癌患者的样本来自拉丁美洲。从墨西哥,601年和552年从哥伦比亚,和499名患者自我报告的非吸烟者。通过肿瘤样本的基因组分析,研究人员发现体细胞表皮生长因子受体突变,喀斯特,其他目标基因。

使用新方法开发的剑Carrot-Zhang博士,和亚历山大·卡博士,研究人员还进行了祖先从肿瘤样本在这个混血人口分析。全球血统分析衡量比例的非洲,欧洲和美洲原住民的祖先在整个基因组。此外,当地的血统分析,评估在特定染色体遗传祖先的位置。因为当地祖先只评估基因组的一小部分,更少可能观察到协会由环境因素或社会经济地位抱愧蒙羞,这可能被视为在全球血统分析,安德森解释说。

使用基因组和祖先的数据,研究者们评估了关联目标基因的体细胞突变和全球祖先群体在一个混血人口。调整后的各种因素,包括自我报告的吸烟状况和sample-specific肿瘤突变负担,研究人员发现,全球印第安人血统呈正相关,表皮生长因子受体基因突变的可能性。此外,研究人员发现,印第安人的祖先是主要与致癌表皮生长因子受体基因的突变有关,但不是non-oncogenic突变。

安德森和他的同事然后分层患者通过自我报告的吸烟情况和评估全球祖先之间的关系,在目标基因突变。从未吸烟者和吸烟者,全球美国原住民血统与表皮生长因子受体基因的突变有关,这表明与印第安人的祖先是独立相关的基因组差异吸烟的状态。

“吸烟KRAS-mutant肺癌的风险增加,而那些不吸烟的肺癌患者经常开发EGFR-mutant肺癌,”安德森说。“然而,我们在研究中显示,EGFR-mutant肺癌也升高在吸烟者中印第安人的祖先。”

研究人员下一步开发当地的印第安人血统风险评分来评估协会的祖先与表皮生长因子受体基因突变频率在多个不同的网站。他们发现祖先之间的相关性和表皮生长因子受体基因突变频率增加的可能性更大在当地的基因组水平比全球基因组水平。“这些结果表明,生殖系基因以及环境因素或社会经济地位,也许会影响EGFR-mutant肺癌的风险在那些印第安人血统,”安德森说。

领导的共同研究一下;卡西,医学助理教授丹纳-法伯和哈佛医学院;我们共同的,医学博士,安德烈斯·卡多纳·德尔国家/基础临床癌症研究和应用(FICMAC)在波哥大,哥伦比亚;奥斯卡的实习,医学博士,头胸肿瘤在西班牙de Cancerologia墨西哥城。Carrot-Zhang,丹娜-法伯癌症研究所博士后研究员和广泛的研究所和研究的第一作者,发达与卡计算方法,进行大量的计算分析。

作者的评论:“现在许多肺癌靶向治疗或免疫疗法可以治愈,”安德森继续说。”是非常重要的肺癌患者进行体细胞基因检测可能判断哪种治疗方式是最有效的为他们的特定的癌症。”

研究局限性:研究的局限性包括一个小样本大小,Meyerson说杜绝识别的特定基因或站点的生殖系与体细胞表皮生长因子受体突变增加有关那些印第安人血统。进一步,研究人员只知道热点突变检测和蛋白质删除突变基因在肺癌的驱动,和未来的工作需要全面描述肺癌基因组从拉丁美洲病人,Meyerson说。

资金和披露:本研究支持转化研究奖的斯图亚特·斯科特纪念基金V基金会和美国国家癌症研究所。安德森是美国癌症协会的研究教授。

Meyerson OrigiMed的科学顾问委员会主席,一个发明家的专利授权给LabCorp诊断表皮生长因子受体基因突变,与表皮生长因子受体抑制剂未决的专利申请。Meyerson收到拜耳研究经费,詹森,新生企业,小野药业有限公司

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