NCI癌症研究中心创建网络临床蛋白质组学技术

美国国家癌症研究所(NCI)的一部分美国国立卫生研究院的宣布,资助其1.04亿美元的一个主要组成部分,五年临床蛋白质组学技术倡议为癌症(CPTI)。

奖金共计3550万美元在未来五年将建立一个协作网络的五个临床蛋白质组学技术评估癌症(CPTAC)团队。

这些团队将补充专业知识,评估测量技术的全谱蛋白质和肽相关临床癌症研究和实践。

CPTAC将指导并提供更广泛的癌症研究社区的资源。

网络的协作将使研究人员在不同的实验室进行癌症相关蛋白研究,利用蛋白质组学技术和方法直接比较和分析他们的工作。

“新兴的蛋白质组学技术有潜力提高癌症诊断和治疗,但我们必须小心,始终,并系统地检查他们在每一个主要的步骤在测量过程中,为了实现自己的全部潜力,”NCI主任约翰·e·Niederhuber说,医学博士

CPTAC获奖者被选择为基础,部分蛋白质组研究的广泛的专业技术团队和他们的熟悉和经常使用广泛的蛋白质组学技术。

这五个CPTAC团队定义了一个跨机构和多学科评估中心网络评估和比较不同的商业化蛋白质组学平台和分析软件包中潜在的适用性的癌症。

他们还将共同开发一个全面的方法来评估intra-platform和实验室内部变化在这些测量技术。

获奖者包括(按字母顺序排列的调查员领导机构团队):

- - - - - -广泛的麻省理工学院和哈佛大学、剑桥、质量:史蒂文·a·卡尔博士。
- - - - - -加州大学旧金山/劳伦斯伯克利国家实验室:苏珊·j·费舍尔博士。
- - - - - -范德比尔特大学医学院纳什维尔,田纳西州。丹尼尔·c·Liebler博士学位。
- - - - - -普渡大学印第安纳州西拉法叶。弗雷德·e·雷尼埃博士。
- - - - - -纪念斯隆-凯特琳癌症中心纽约,纽约州:保罗Tempst博士。

“这个项目是一个关键组成部分NCI的策略利用蛋白质组学的诊断和治疗潜在的癌症患者,“说NCI副主任安娜·d·巴克博士。

“我相信,获奖者的补充蛋白质组学专业知识,和他们承诺inter-institutional协作和实时数据共享,将使生物标记的发展为新一代的molecularly-based干预来诊断,治疗,预防癌症。”

两个主要技术的多学科小组将进行评估目前用于分析蛋白质和肽-质谱和亲和捕获平台。CPTAC项目团队的具体目标包括:

-蛋白质组学技术平台的性能评估和标准化的方法来开发应用程序的平台

——评估蛋白质组学平台的能力分析癌症相关蛋白质组的变化人类临床标本

——建立系统化的方法来规范蛋白质组不同实验室之间的协议和数据分析

——发展和实施统一的共享生物信息算法和蛋白质组学数据分析/数据挖掘工具

——开发良好的材料和生物信息学资源为整个癌症研究社区。

“有远见的计划,NCI承担研究人员面临的最具挑战性的任务之一在蛋白质组学领域,“李哈特韦尔说,博士,总裁和西雅图Fred Hutchinson癌症研究中心的主任,洗。

“这种努力是绝对必要的,如果我们要加速蛋白质组学在临床实践的进步。”

CPTAC是三大之一CPTI程序组件,所有的发达国家在过去的2年科研界的输入。
其他组件包括:

“先进的蛋白质组学平台和计算科学”

这个项目将支持的开发工具和支持技术对蛋白质和肽测量算法和支持开发和计算方法来研究新兴预处理数据集。颁奖典礼将于今年晚些时候公布。

“临床蛋白质组学试剂资源”

这个项目将作为一个中心(虚拟)试剂来源(化学物质纯度足够用于化学分析)科学界。

资源将开发标准试剂,执行特性,提供一个交互式资源目录通过癌症生物医学信息学网格™(caBIG™),加快收购和销售试剂和试剂的性能数据。今年的奖项和申请过程将会宣布。

三个CPTI程序组件(CPTAC,先进的蛋白质组学平台和计算科学和临床蛋白质组学试剂资源)集成NCI努力解决一些基本的科学要求,必须满足为了实现蛋白质组学为癌症诊断和治疗的承诺。