网络集群揭示了系统性的线粒体蛋白表达变化

文摘
线粒体蛋白曲目不同取决于细胞状态。蛋白质成分修改引起的线粒体DNA (mtDNA)消耗各种人类疾病相关;然而,很少有人知道如何nuclear-encoded线粒体蛋白质(太蛋白质组)变化在这种不正常的状态。在这项研究中,我们调查的系统性变化mtDNA-depleted(ρ(0))线粒体通过使用网络分析的基因表达数据。通过模块化量化蛋白质组学数据为蛋白质的功能网络,系统性的线粒体功能障碍的性质进行了分析。我们发现上调和下调蛋白质被组织成两个主要子网,表现出不同的生物过程。衰减网络模块涉及到典型的线粒体功能,同时上调蛋白质负责mtDNA维修和监管的蛋白表达和运输。此外,比较蛋白质组和转录组数据显示,ρ(0)细胞试图弥补mtDNA损耗调制协调表达/运输的蛋白质。我们的研究结果表明,mt蛋白成分改为改造线粒体蛋白质网络的功能性组织为了应对不正常的细胞状态。人类太蛋白质功能网络提供了一个框架来理解细胞如何应对线粒体功能紊乱。

这篇文章是发表在《公共科学图书馆·综合》杂志上,自由访问。