新提取协议RNA-Seq和代谢组学分析
Van Andel研究所科学家开发出了一种新的提取协议RNA-seq和代谢组学分析,提供一个更完整的细胞活动的照片比技术本身。
协议采用流线型的提取从一个样本,从而减少变异,提高效率,保存数据保真度和最大化利用宝贵的biospecimens。
“我们的新技术使研究人员研究代谢表型以独特的方式而得到最多的信息我们可以单样本,”说瑞恩•谢尔登博士。VAI的主任质谱分析的核心。“最重要的结论是没有损失的信息通过使用我们的新,更高效的协议。”
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免费订阅直到现在,科学家们必须使用两个样本的抽取,——一个用于RNA-seq,另一个用于代谢组学。这种方法需要多个样品或单个样本分为次级样本,从而增加变异和未知影响数据的解释。
当前工作流也会使multi-omics方法具有挑战性的,尤其是在罕见的样本类型;提取过程破坏了样本,从而排除额外的分析。
验证协议,该研究小组的结果相比标准提取新方法的结果。调查结果清楚地显示,新协议保存数据质量,同时节约时间和资源。
发表在《华尔街日报》的新协议RNA生物。它是由科学家VAI的核心技术和服务和代谢和营养编程。核心技术和服务提供了最先进的技术和专业知识来研究所科学家和合作者。
“我们的新战略提供了一个重要的概念验证将额外的组学方法,为未来努力的目标是创建一个单一提取管道RNA-seq、代谢组学、蛋白质组学、转录组,和其他人,”谢尔登说。“这项工作不可能一直没有特殊的核心技术和服务团队在VAI和研究所合作和严格科学的承诺。”
参考:Madaj ZB, Dahabieh女士,Kamalumpundi V, et al。之前代谢物提取完全保留RNAseq质量,使综合多的肝脏代谢组学分析应对病毒感染。RNA生物。2023;20 (1):186 - 197。doi:10.1080 / 15476286.2023.2204586
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