新的深入了解卵巢癌生长和发展

在《华尔街日报》发表的一篇论文癌症研究副教授李维沃尔德伦、路德维希Geistlinger博士后研究员和同事实现人口健康科学研究所城市大学研究生院(ISPH)的公共卫生和卫生政策(城市大学SPH)提供新的深入了解卵巢癌在一个人成长和发展。

纸”,Multi-omic亚型分析进化和异质性中高档卵巢浆液性癌”[1]的基础科学兴趣的方法和见解几十年肿瘤发生的过程,和实际利益的影响这些见解对subtype-targeted疗法的可行性。20000多名妇女接受一个新的诊断卵巢癌在美国,每年,大约每年有14000人死亡。

“了解异构肿瘤发展诊断是困难的,因为之前我们不能直接观察到,进化,”沃尔德伦教授说。“但是通过观察肿瘤识别在不同阶段的演化,并通过详细的调查肿瘤基因组学和异质性,我们还是可以学到一些东西。关键我们想知道的是是否肿瘤开始作为某些亚型和保持这样,或者发展,随着时间的推移变化,甚至繁殖亚型。如果亚型可以进化,用在一个肿瘤,然后subtype-specific疗法不太可能帮助。”

回答这些问题,团队开发了一种新方法,推断不同亚型的存在从互补类型的基因组数据,分别发表在《临床肿瘤学临床癌症信息学[2],并与来自明尼苏达大学的研究人员利用新技术单一细胞的RNA序列。

“我们使用互补但方法同样的问题——一个完全不同的方法使用更传统的方法使用DNA和RNA序列数以百计的大部分肿瘤,和其他使用新的几个肿瘤单细胞测序方法,”沃尔德伦了,“看到一致的从这两种方法确实加强了对结果的信心来自两个新方法。”

一个令人惊讶的结果的研究是一个解雇离散转录组的想法子类型癌症,肿瘤和替代模型的连续发展,包括混合物的积累,积累的突变,免疫细胞和基质细胞的渗透比例与肿瘤阶段,组织的起源、和属性之间的进化之前与离散亚型有关。

“不幸的是,先前的离散亚型的想法过于简单,不可能进步我们的理解,预防或治疗这种疾病,”沃尔德伦说。“幸运的是,新兴的肿瘤异质性清晰,和技术的快速发展,帮助理解,我们有条件取得进展。”

该项目涉及的主要与明尼苏达大学合作进行单细胞RNA序列,和丹娜-法伯癌症中心,阿肯色大学医学科学,诺华生物医学研究所研究、纪念斯隆凯特林癌症中心,罗斯威尔公园综合癌症中心。城市大学SPH博士后Sehyun哦,英里校友马塞尔·拉莫斯和卢卡斯希弗也参与这项研究。

引用

[1]Geistlinger L, et al。(2020)。Multi-omic亚型分析进化和异质性中高档卵巢浆液性癌。癌症Res。DOI:https://cancerres.aacrjournals.org/content/early/2020/08/01/0008 - 5472. - 20 - 0521

[2]哦,Geistlinger L, et al。(2020)。可靠的临床分析Tumor-Only Whole-Exome测序数据。JCO临床癌症信息学。DOI:10.1200 / CCI.19.00130

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