新方法检测RNA病毒发达

巴塞罗那大学的专家,加泰罗尼亚的先进化学研究所(IQAC-CSIC),巴塞罗那微电子研究所的阿拉贡(IMB-CNM-CSIC)和纳米科学和材料研究所的阿拉贡CSIC (INMA)——联合研究所和大学的萨拉戈萨,已经开发出一种新的方法来检测基于triplex-forming RNA病毒探针技术。这种创新方法开辟了新的选项SARS-CoV-2等检测病毒、甲型流感病毒(H1N1)或呼吸道合胞体病毒(RSV),影响新生儿的病原体,需要仔细的鉴别诊断。

这个跨学科的研究,发表在国际分子科学杂志》上,由卡洛斯·j·Ciudad和维罗妮卡诺,教员的制药和食品科学和纳米科学和纳米技术研究所(IN2UB)巴塞罗那大学的;雷蒙Eritja,安娜Avino Lluisa Vilaplana和m·皮拉尔马可从IQAC-CSIC cib生物工程,生物材料和纳米(CIBER-BBN);曼努埃尔•古铁雷斯·安东尼Baldi和塞萨尔费尔南德斯从IMB-CNM-CSIC和瓦Grazu耶稣马丁内斯,CSIC纳米科学研究所的研究人员和材料和阿拉贡INMA (CSIC-UNIZAR)和CIBER-BBN。

这项研究是在PoC4CoV的背景下进行的项目,由m·皮拉尔马可和塞萨尔费尔南德斯和资助通过CSIC的全球卫生平台(PTI)。的研究仍在继续作为项目的一部分,由洛杉矶Marato de TV3 2020对抗COVID-19,来自化学学院的专家的乌兰巴托也参与。

Polypurine发夹来捕获病毒RNA

的新方法是基于能力polypurine发夹(PPRHs)联合乌兰巴托的癌症治疗组-捕获病毒RNA和形成的高亲和性三缸。当这种混合结构是连接到一个分子探针和放置在接触样本受影响的病人,病毒剂的检测信号。方法在科学出版物叫做三缸增强核酸检测试验(TENADA)。

“PPRHs修改的单链DNA发夹两镜面域反平行polypurines组成。这些领域,连接到对方的胸苷循环,通过分子内reverse-Hoogsteen债券有关。分子发夹可以绑定专门polypyrimidine单链DNA序列(ssDNA),双链DNA (dsDNA)或RNA病毒通过沃森克里克债券,从而形成一个反平行的三缸”,卡洛斯·j·Ciudad教授说,从乌兰巴托的生物化学和生理学。

一个有效的和更快的比PCR检测方法

病毒RNA的检测优势,没有干预的PPRH方法可以应用逆转录酶,这种酶将RNA, DNA -或thermocycler(放大的设备样本的遗传物质聚合酶链反应或PCR)。此外,它有一个相当于的敏感性和特异性PCR测试并提供结果在不到一个小时。

作为研究的一部分,研究小组使用了三明治杂交策略在几个biodetection设备。这个策略使用两个寡核苷酸:triplex-forming PPRH发夹作为捕获探针和一个标记duplex-forming DNA寡核苷酸作为检测探针。

“triplex-forming PPRH发夹旨在结合SARS-CoV-2 polypyrimidine序列,而检测探测器被设计成互补区域接近polypyrimidines的目标站点。因此,SARS-CoV-2 RNA的存在是被三元的形成复杂的生物传感器表面”,维罗妮卡诺伊(UB-IN2UB)教授说。

这种方法已经在一个紧凑的电化学装置,实现集成二电极电化学电池芯片——IMB-CNM-CSIC微观和纳米加工生产洁净室和射流组件在纸上,在热侧流系统中实现硝基和使用电浆纳米颗粒和热敏纸已开发的INMA (CSIC-UNIZAR)。

TENADA:在生物医学研究中的应用

PPRHs作为工具,科学文献中描述的几个基因主要参与癌症的基因沉默。此外,他们还被合并为探针在生物传感器检测的小RNA分子(microrna)来确定DNA甲基化状态和诊断肺炎由真菌引起的卡式肺。

现在,新的TENADA方法被证明是有效的病毒颗粒不仅检测。高亲和力的PPRHs病毒RNA是一个属性,可以应用于抑制病毒复制过程。出于这个原因,的抗病毒特性polypurine发夹剪辑CC1PPRH和CC2PPRH VeroE6谱系细胞的感染SARS-CoV-2病毒粒子也被研究。

参考:Avino, Cuestas-Ayllon C,尹浩然,Gutierrez-Capitan。检测三缸增强SARS-CoV-2病毒的核酸检测试验(TENADA)。IJMS。2022;23 (23):15258。doi:10.3390 / ijms232315258

本文从以下转载材料。注:材料可能是长度和内容的编辑。为进一步的信息,请联系引用源。