新的超级计算机资源支持埃克塞特大学的研究人员

来自埃克塞特大学的研究人员正受益于一个新的高性能计算(HPC)机器,叫做Isca。现有部门HPC资源在生命科学和物理学到生命的终结,所以使用大学的资金和一个大授予来自英国医学研究理事会,获得一个新的大学核心高性能计算资源来支持大学的研究者在许多学科。

新系统已经导致研究的造型和恒星和星系的形成,利用计算流体动力学(CFD)在工程了解洪水影响桥梁,以及用于医学院观察糖尿病的遗传性状,使用的数据来自英国生物库。HPC资源现在使用的200多名研究人员在30 +项目在积极研究生命科学,工程,数学,天体物理,计算部门。

大学作为原投标的一部分,要求选择提供临时住房新HPC机同时工作的一个新的数据大厅被完成。高性能计算、存储和数据分析积分器,OCF,提出了一个独特的解决方案的新HPC机快速部署数据中心(RDDC)容器以及技术解决方案集成有限公司(原英国TSI)。

豆荚的绰号,这是一个专用HPC-related出口集装箱以及技术集成开发的解决方案,这是大学的数据中心的定制设计和制造专家。HPC机OCF设计、集成和配置,整个系统在它的容器大学在2016年7月。

“这是第一阶段的新超级计算机,位于校园的专门的容器,机器跑前十二个月的地方,”戴维·巴克说,他在埃克塞特大学的技术架构师。“我们测试和使用系统时安置在临时位置给我们了解我们大量的使用;本通知第二阶段的项目,扩大系统OCF的帮助下,把它转移到其最终位置在新校园数据中心”。

此外,OCF和联想共同致力于计算机的设计来支持生命科学和物理学研究人员的不同需求,需要分别虚拟化和传统环境。6000年新核心系统由联想NeXtScale服务器的NVIDIA GPU节点,φ英特尔至强处理器和其他高端内存的计算机资源来满足这些需求。

联想的NeXtScale服务器通过Mellanox EDR Infiniband连接三个GS7K并行文件系统电器从DDN存储,提供下一个字节的能力。OCF的开源HPC软件栈,基于XCAT,运行在系统随着RDO OpenStack,漂亮的直流电压和自适应计算摩押。

”以及标准的节点,我们也有各个部分的专业设备,包括NVIDIA GPU节点,Intel Xeonφ节点和OpenStack云节点,”大卫说。“我们想要确保新系统满足尽可能广泛的各种各样的研究项目,因此系统的多样性反映了应用程序和要求我们的用户”。

它对研究的影响显著,与研究人员看到好几次加速比前一部门集群。

“我们已经看到在过去的几年里真正的高性能计算从生命科学的兴趣的增长,特别是在新型高保真基因组测序仪的可用性,沉重的计算需求,需求将会持续增长,”David Acreman评论埃克塞特大学的高级研究员。“Isca被证明是一个非常有价值的服务,整个大学,现在是我们研究小组证明不可或缺。”

本文从提供的材料已经再版埃克塞特大学。注:材料可能是长度和内容的编辑。为进一步的信息,请联系引用源。