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新的测试方法诊断COVID-19近乎完美的准确性

插图的RNA和蛋白质分子。
信贷:Kouzou酒井法子/西蒙斯的基础

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通过检查身体的免疫反应在分子水平上,一个研究小组开发了一种新方法来测试COVID-19病人。他们的方法就有可能让感染暴露后数小时,远早于当前COVID-19测试可以检测出病毒——近乎完美的准确性。团队描述了他们的创新,目前仍在开发的早期阶段,在2月27日出版的细胞报告方法


大多数现有COVID-19测试”依靠同样的原理,那就是你积累了数量检测的病毒材料,例如,在你的鼻子,”研究报告的主要作者弗兰克说,从事该项目作为一个熨斗熨斗研究所研究员计算生物学中心(CCB)在纽约市。”,提出了一个挑战的时候在感染的早期时间窗口和你没有积聚了大量的病毒材料,或者你无症状。”

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新技术而不是根据我们的身体免疫反应在SARS-CoV-2入侵时,山导致COVID-19的病毒。当攻击开始,打开特定的基因。片段的基因产生mRNA分子指导蛋白质的建筑。这些信使rna分子的特定的混合生产蛋白质的种类变化,包括蛋白质参与抵抗病毒的功能。新方法可以自信地识别当身体越来越多的免疫反应COVID-19病毒通过测量各种信使rna分子的相对丰度。这项新研究是第一个使用这种方法来诊断传染病。


研究人员调整他们的方法使用血液样本2020年的一项研究参与者之前和之后的美国海军新兵COVID-19。研究者的计算框架确定了超过1000个变异mRNA-variant比例变化。


当使用真实的血液样本,考验新方法产生一个令人印象深刻的98.4%的准确率。尤其让人印象深刻的方法也能很好地工作在无症状患者,为谁快速抗原测试可以准确的不到60%。“真的很奇怪,这工作很好,”张说,现在在cedars - sinai医学中心的助理教授在洛杉矶。“这是一个有前途的替代和补充常规PCR方法测试。”


新方法还没有准备就绪,张医生说。他和他的同事只检测血液样本而不是更常见的鼻样本和诊断COVID-19方便。同时,他们需要确保他们可以区分身体的反应COVID-19及其应对其他病毒引起的感染,如感冒。


研究人员说,他们是乐观的,不过,其他的研究小组已经在测试上取得进展,只看哪些基因打开。这些测试可以很容易地添加mRNA分析发达国家在这项新的研究中,从而产生更好的结果,张医生说。“什么他们可以做,我们可以探索和加入部队,“包括感染病例数小时内首次曝光。


张在计算方面的工作项目以及建行研究员娜塔莉Sauerwald和基因组学Olga Troyanskaya建行副主任。斯图尔特的Sealfon伊坎在纽约西奈山医学院领导工作研究的生物组件,与标准在旧金山BioTools发展中测试设置。


参考:张Z, Sauerwald N,卡普西奥,et al .血液RNA可变剪接事件作为传染病诊断生物标记。细胞报告方法。杂志2023;3 (2):100395。doi:10.1016 / j.crmeth.2023.100395


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