使用基因组定序器技术发现新病毒

454生命科学研究人员宣布哥伦比亚大学和维多利亚时代的传染病参考实验室发现了一种新病毒,负责三个移植受者死亡。

研究解释了以前未知的病毒,这是与淋巴细胞choreomeningitis病毒有关,被发现使用454测序™技术和发表在网上新英格兰医学杂志》上。

研究,题目是“发现和暗示小说集群中的沙粒病毒致命的移植相关的疾病,”描述了如何确定这种病毒可能会使改善筛选,将提高移植的安全性。

死亡后的所有三个器官接受者从单一捐赠者,他们的疾病调查公正454高通量测序揭示先前未被发现的旧世界沙粒病毒的存在。病毒,类似于淋巴细胞choreomeningitis病毒和Kodoko病毒,随后被证实在多个临床样本通过PCR,病毒文化和免疫组织化学。研究结果表明这种新的沙粒病毒的人类病原体和支持使用高通量测序在病原体的发现。

“在几天内我们有线索的身份负责移植的病毒死亡”伊恩·利普金说,医学博士,该研究的第一作者和流行病学和神经学教授约翰·斯诺教授和哥伦比亚大学病理中心主任感染和免疫梅尔曼公共卫生学院的。

“我们做了这个调查最高优先级。我们的成功反映了一个非凡的团队的调查人员的不懈努力表示学术界,公共卫生和工业,把他们所有的专业知识和技术,一个重要的临床问题。”

“我们非常满意地看到,新病毒基因组定序器系统可以快速识别,其他方法失败了,”曼弗雷德-拜尔表示,罗氏应用科学。“这是另一个例子的潜力454测序技术在各个应用领域。病毒的识别是一个重要的第一步,进一步提高移植的安全性。”

“454测序使研究人员能够快速、实惠识别生物存在于一个复杂的样品没有任何先验知识的病原体存在“埃霍尔姆迈克尔说,博士,研究报告合著者和副总统在454生命科学研究和发展。“这宏基因组方法病原体识别可能促进更快速反应当“SARS”有时会出现在未来。”