NHGRI宣布拨款1330万美元

的国家人类基因组研究所(NHGRI),国立卫生研究院(NIH)的一部分,宣布了最新一轮的总价值为1330万美元的奖励,测序技术的发展速度,降低DNA测序的成本和扩大使用基因组学在医学研究和医疗保健。

“重大进展在过去的几年中发展更快、更具成本效益的测序技术,我们致力于支持这些创新的努力造福科学实验室和医疗诊所,“弗朗西斯•s•科林斯美国国家人类基因组研究所主任说,医学博士博士。

“这些技术最终将彻底改变生物医学研究和医学实践完成。”

NHGRI的近期目标是降低mammalian-sized基因组测序的成本为100000美元,允许研究人员序列的基因组数百甚至数千人参与的研究来识别基因为常见,复杂的疾病。

最终,NHGRI的愿景是全基因组测序的成本减少到1000美元或者更少,这将使个人的基因组的测序在常规医疗服务。

个体基因组序列的能力能使卫生保健专业人员调整诊断、治疗和预防每个人的独特的基因档案。

赠款将基金9调查人员开发技术,可以使其可行的一个基因组序列为1000美元,以及两个调查人员“短期”技术发展一个基因组序列为100000美元。

这两种方法有很多互补元素整合生物化学,化学和物理与工程来提高整个努力开发下一代DNA测序和分析技术。

“是非常重要的,我们鼓励和支持创新的测序技术的发展,”杰弗瑞城堡说,博士,NHGRI技术开发的项目负责人。

“其中许多新方法显示重要的承诺,然而更多的勘探和开发是必要的,如果他们是有用的平均研究员或医生。”

“我们期待看到的这些技术履行承诺,实现需要DNA测序的量子跳跃到下一个水平。”

NHGRI的“革命基因组测序技术”拨款作为他们的目标技术的发展将使一个人体大小的基因组被测序为1000美元或更少。

赠款接受者及其近似资金总额:

——约翰•纳尔逊博士,通用电气公司全球研究,纽约尼什卡纳
- 900000美元(2年)
——“封闭的复杂的单分子测序”

这个团队将使用现有的酶和dye-tagged核苷酸资源,DNA的构建块,将简化的基本方式,前端大规模并行sequencing-by-synthesis化学。

这种方法使用的自然催化循环DNA聚合酶只捕捉一个基于固定化底漆/ DNA模板。

荧光扫描仪将用于扫描和识别成千上万的分子。

然后循环会重复。这个阶段性奖励会增加如果满足特定的里程碑在最初的实验。

——j·迈克尔·拉姆齐博士北卡罗莱纳大学教堂山分校
- 380万美元(4年)
——“纳米流体技术快速测序单个DNA分子”

纳米是一米的1000000000,太小,用常规实验室显微镜。

几组正在开发纳米孔(孔直径约2纳米)用作DNA序列传感器并提出检测电子,从单个DNA分子或离子信号。

这个小组的目标是制造纳米通道DNA单分子将通过nano-electrodes之间相距2纳米,测量电流,确定个人的基地。

——小华黄博士加州大学圣地亚哥分校,拉霍亚
- 275000美元(1年)
——“基因组测序单个DNA分子通过结扎使用Nano-Arrays”

使用一个DNA测序实验方法称为“单分子测序结扎,“这个项目旨在开发一种方法制造高密度阵列的井sub-micrometer尺寸订购单一纳米粒子和DNA分子。

研究者将试图证明10亿个人DNA分子可以在大规模并行测序虽然结扎循环测序过程中,一个过程,一种酶用于连接一起的DNA片段。

这个阶段性奖励会增加如果满足特定的里程碑在最初的实验。

- - - - - -阿米特情节剧电影博士波士顿大学、波士顿
- 220万美元(3年)
——“高通量DNA测序使用设计聚合物和纳米孔阵列”

这个小组将继续实现一个方法之前通过这个项目资助的纳米孔用于同时检测电气和荧光信号从许多纳米孔。

测序仪器将捏造,以及额外的分析工具,目的是产生一个可行的测序系统。

——蒂莫西·d·哈里斯博士Helicos生物科学公司、剑桥、质量。
- 200万美元(3年)
——“高精度单分子合成DNA测序”

这个团队的调查人员已经开发了一个完全自动化的仪器能够单分子测序DNA在平面的表面上。

集团目前发展这项技术的高通量版本为整个人类基因组的重排序。

测序策略涉及到获得短从数十亿读取(约25个DNA碱基)股DNA的细胞固定化试剂流内部的表面上。

俄罗斯——诉Vezenov博士利哈伊大学,伯利恒佩恩。
- 905000美元(3年)
标签——“力谱平台免费基因组测序”

这个团队将迫使光谱,一种技术用于理解聚合物分子的力学性能或化学键,最初DNA进行逮捕聚合展示one-molecule-at-a-time分析分子力学的变化在单个碱基的决议。

使用光学、近场探测的方法迫使光谱学可以先进技术在大规模并行的格式,在数以百万计的单一DNA基础增加可以在同一时间。

确定基地将专门的基础上完成整个分子所经历的变化。

团队的目标是制造一个桌面设置适用于大多数生物,化学实验室和医院。

——Peiming Zhang博士亚利桑那州立大学美国亚利桑那州坦佩。
- 895000美元(3年)
——“制造通用的DNA测序的纳米阵列杂交”

扩大sequencing-by-synthesis技术的性能,这个小组将开发一个方法来制造普遍使用nano-contact打印出DNA纳米阵列。

目前光刻技术可以破坏DNA探针,该集团将努力避免使用nano-contact印刷。

DNA纳米阵列的纳米级功能,还可以通过提高吞吐量的能力容纳数十亿DNA分子在小范围之内。杂交将原子力显微镜探测到。

——卡洛斯·h·Mastrangelo博士凯斯西储大学克利夫兰
- 815000美元(3年)
——“大规模的纳米孔阵列的DNA测序”

这个团队将致力于开发集成的纳米孔阵列可以通过光刻制造方法,以及片上硅基电子电路和放大电路技术和隔离各种电信号。

这个小组还将设计一个dipole-sensing方法,原则上可以区分从每个DNA碱基的信号。

纳米孔阵列将建在硅基板用自对准的方法。

正交偶极矩探测器将构造,产生一个信号独立旋转的DNA分子相对于电极。

——Jens Gundlach博士华盛顿大学、西雅图
- 605000美元(2年)
——“纳米孔测序工程MspA”

通过使用电泳单链DNA通过纳米孔,一个方法使用一个应用电场分析分子结构,有潜力成为一个超速的DNA测序技术。

最新纳米孔测序的研究涉及到蛋白质毛孔,a-hemolysin;在无机材料或人工毛孔。

这个侦探将探讨使用不同的蛋白质毛孔,分枝杆菌smegmatis孔蛋白(MspA),纳米孔测序作为一种新的工具。

——“基因组”100000美元拨款

NHGRI的基因组测序”的“短期发展赠款将用于支持研究旨在测序一个人身大小的基因组在今天比是可能的成本低100倍。

有强大的潜力,在过去5年中,这些技术将达到或接近的几个商业可用性。

赠款接受者在当前周期及其近似总资金:

——迈克尔·l·Metzker博士人类基因组测序中心,贝勒大学医学院,休斯顿
- 500000美元(1年)
——“超速的SBS(由合成测序)方法对大规模人类重新排序”

这个团队已经开发出一种类型的荧光核苷酸,是综合排序的修改。

他们的目标是提高化学子单元,称为可逆终止剂,用于一个系统,最终将序列DNA模板用于高密度阵列,使用敏感的荧光检测系统。

——史蒂文Jeffrey Gordon博士智能就近,Inc .,伍斯特的质量。
- 425000美元(1年)
——“高通量DNA测序综合平台”

这个项目的主要目的是建立一个高速、大规模并行DNA测序系统使用独特的基类似物可分裂的染料和可逆的终结者组和综合排序的方法。

这个应用程序集中在子系统的发展要求构建高密度样本阵列玻璃芯片和测序运行综合反应的自动化,高通量时尚。