NIH添加大量的基因、健康信息在线数据库

数据,从一个国家的最大和最多样化的基因组学项目——遗传流行病学研究衰老(基拉)——刚刚提供给合格的研究人员通过数据库的基因型和表型(dbGaP),一个在线遗传学的美国国立卫生研究院的数据库。

队列-平均年龄63 -基拉是由凯撒医疗机构协作开发和加州大学旧金山分校)。添加数据dbGaP成为可能的2490万美元的国家衰老研究院的支持(NIA)和国家精神卫生研究所,和办公室主任,国家卫生研究院。凯瑟琳Schaefer博士的Kaiser Permanente北加州和Neil Risch博士,加州大学旧金山分校的是基拉的首席调查员。

“数据从这个巨大的和种族多元化的人口将是一个巨大的科学资源,”国家卫生研究院主任弗朗西斯•s•科林斯说,医学博士博士”。它提供了机会识别潜在的遗传风险和影响广泛的健康状况,特别是老化有关。”

基拉队列研究项目的一部分,在基因,环境,和健康(RPGEH),其中包括430000多名成人的Kaiser Permanente加州北部系统。数据从这个大群体包括电子病历、行为和人口信息调查,唾液样本200000名参与者获得知情同意的基因组和其他分析。RPGEH数据库成为可能主要通过早期Robert Wood Johnson基金会的支持,加快卫生研究。

“基拉群最多的人——任何年龄的——dbGaP数据,“NIA主任理查德•j•赫德说,医学博士“联邦基金被用来开发新的基因组学方法对于这个项目,我高兴的是,现在的数据可以在dbGaP供研究人员使用。我期待着新见解,这种独特的资源可以提供更好的健康。”

基拉群中的遗传信息转化为超过550亿位的基因数据。使用新开发的技术,研究人员进行了全基因组扫描来快速识别单核苷酸多态性(snp)的基因组群基拉的人。这些数据将形成的基础全基因组关联研究(GWAS),可以看到成百上千,成千上万的单核苷酸多态性在同一时间。RPGEH然后结合基因数据信息来自Kaiser Permanente的综合纵向电子病历,以及广泛的调查数据对参与者的健康习惯和背景,为研究人员提供了一个无与伦比的研究资源。

除了传统上与年龄增长有关的疾病和条件,如心血管疾病、癌症和骨关节炎,研究人员能够探索潜在的遗传基础的疾病,影响人们在成年期,包括抑郁症、失眠、糖尿病、某些眼部疾病和许多其他领域代表各种各样的疾病。研究人员还可以利用数据库来证实或反驳其他研究使用相对较小的人的数据,以及增加他们的样本的大小和力量通过添加参与者从基拉到荟萃分析。大群也将作为参考源的控制,研究人员可以比较不同条件下个人与他们的研究。

“这个数据集的一个令人兴奋的方面是,它将被更新和刷新,”雷德•罗西表示,NIA的部门副主任老年病学及临床老年病为项目和项目官员。“作为信息添加到Kaiser-UCSF数据库,dbGaP数据库也将被更新。”

dbGaP是发达国家和由国家生物技术信息中心,管理一个部门在国家卫生研究院的国家医学图书馆。调查人员有兴趣申请访问这个数据库应该遵循的程序在dbGaP网站上。