国家卫生研究院提交6.7美元推动DNA, RNA测序技术

Wanunu博士,东北大学物理系助理教授,肯定不是一个人在他的惊讶。DNA测序领域充满了想法,只是足够疯狂工作。我们现在有技术,使用光发光分子发出来找出正确的顺序的DNA序列,和一个电池开发装置,利用电流破译基因组。

“部分基因组保持隐藏,或者很难用当前的方法分析,”杰弗瑞说城堡,博士,部门主任基因组科学国家人类基因组研究所(NHGRI)。“如果我们看不出有什么,我们不能学习它是如何工作的。新技术仍然是需要的。”

为此,NHGRI授予670万美元的新研究资助发展更敏感的DNA测序技术,更快,更便宜和更精确的比我们已经有了。这些新的奖项再服兵役的投资,通过基因组技术项目开始于2004年。

“直接RNA序列是特别令人兴奋的一个方面的这些新的奖项,”迈克尔说史密斯博士项目主任NHGRI的基因组技术项目。“奖项使小说研究RNA功能大片土地生物医学和生物学研究。”

信息存储在我们的DNA转化成RNA转录许多生物学功能,包括包含基本的蛋白质。基因组的RNA是一个重要的产品,在一个角色,直接负责,多少蛋白质是我们身体的每个细胞。然而,尽管许多试图开发技术直接RNA序列,它继续隐藏它的许多奥秘。

当前的方法,使用下一代DNA测序来描述所有的成绩单表示在给定的时间(统称为转录组),包括一个中间步骤,研究人员必须RNA转化为互补DNA(互补),这样当前测序机器可以阅读它。这是一个不完美的复制过程,当结合短测序读,比其他人更容易导致一些记录被测序,是重新组合转录组的难题和困难。这些限制最终导致不精确和不完整的基因表达和转录家里的多样性。

此外,这种做事方式可以完全忽略阅读RNA的化学修饰,解释斯图尔特·林赛博士,亚利桑那州立大学的物理和化学教授,和程序的受让人。这些化学修改可以改变一个表达基因的功能或修改多稳定的细胞。

新能力直接序列RNA将允许研究人员解决一组全新的实验。这些实验不仅在实验室的研究领域有广泛的应用,而且在诊所。

“最令人信服的理由直接RNA序列的使用是精密医学“Wanunu博士说,他的奖金将被用来克服的一些挑战与RNA序列直接相关。“我们已经可以一个人的基因组序列,和六十亿个字母会告诉你很多关于他们,但转录组可以补充。”

林赛博士同意:“转录组可以比基因组医学信息在某些情况下,”他说。“基因表达的癌细胞比正常细胞是不同的。”

Drs。Wanunu和林赛并不孤单在他们的创造性的方法来解决问题。总共六个新奖项已经通过一个名为小说核酸测序技术发展项目(以前称为先进的测序技术奖励计划)。这些项目关注的各种问题等核酸测序工作专注于直接RNA序列进一步改善纳米孔测序的DNA。

“这特定的程序在许多方面是独一无二的,”Wanunu博士说。“它有科学支持来自不同背景的人从化学家,物理学家,生物学家的工程师。我们面临这些挑战在这个领域是非常真实的。由于NHGRI,这个程序将继续创造奇迹为了提高核酸测序技术。”