西南大学美国国立卫生研究院的资金新病毒数据库

美国国立卫生研究院授予一份价值1570万美元的合同,UT西南医学中心和诺斯罗普·格鲁曼公司开发一个开放国家在线数据库和分析资源中心将帮助科学家研究和打击病毒如那些引起肝炎、脑炎、天花、急性呼吸窘迫和登革热以及新兴的致病病毒。

国家过敏症和传染病研究所(NIAID),美国国立卫生研究院的一部分,授予合同,指定为UT西南总数的大约270万美元,这将作为项目的分包商。

西南大学以前的工作由理查德•本篇博士教授病理学、临床科学和癌症免疫生物学中心,导致开放获取数据库由美国国立卫生研究院的发展对于流感,包括H1N1大流行性流感病毒通常被称为猪流感。

“当猪流感的第一个基因序列被释放,研究人员有很多关于这种新出现的疾病的问题,“本篇博士说,首席西南大学生物医学信息学。“他们想知道从病毒来自哪里到可以预测的疾病是人类是否有保护性免疫力。”

支持的数据库开发的新合同将西南大学使用流感模型。这种新病毒病原体数据库和分析资源(ViPR)将使研究人员能够开发一个在线生物信息学中心将包含数据和分析工具,广泛的病毒病原体。的病毒数据库的一部分包括Herpesviridae、疱疹、水痘的病原体;黄病毒家族,包括丙型肝炎和西尼罗河病毒;痘病毒,导致天花。

“ViPR资源将支持基因序列数据,病毒感染的免疫反应的信息,和病毒的蛋白质结构信息,“本篇博士说,首席研究员在本地的新合同。“这个数据库将所有信息在一个地方。”

在调查H1N1,本篇博士说他的团队把流感病毒的基因序列进入nih资助的专门研究数据库他监督,发现甲型H1N1流感病毒的遗传编码不像正常的季节性流感病毒的传播。

ViPR,将相同的功能作为流感病毒数据库,将有助于研究人员对其他人类致病性病毒回答类似的问题。最终目标是开发更好的诊断工具,治疗和疫苗,他说。ViPR数据库定于12月www.viprbrc.org可用。

除了提供大量的病毒基因序列信息,ViPR将提供使宿主-病原体相互作用的分析和可视化工具。资源也将支持集成的数据收集方法和地理坐标等监测和流行病学研究,以及临床试验的数据。

本篇博士说在开放获取科学数据共享门户网站像ViPR越来越重要的医疗保健信息的数量和多样性继续积累。

“虽然一致性的数据共享和数据的保护必须定期评估,调查人员之间的合作通常是为了收集足够的数据需要进行有意义的结论,”他说。“这NIAID的生物信息学资源中心就是一个例子,像德州西南医学研究中心的协助下,领导努力和发展基础设施,以支持数据共享。”