NIH人类微生物工程研究人员发布第一个人类微生物基因组的集合

人类微生物组计划(HMP)发表了一个178的基因组分析微生物生活在或对人体。

研究人员发现新基因和蛋白质功能在人类健康和疾病,添加一个新层次的理解什么是知道这些生物体的复杂性和多样性。

人类微生物组包含的所有微生物存在于人体或。超过人体细胞10比1,一些微生物引起的疾病,但很多人对于健康是必要的。目前,研究人员只能种植一些细菌、真菌和病毒在实验室设置。然而,新的基因组技术可以在个体识别微生物的微量DNA,并确定其身份通过比较已知序列的基因签名项目的数据库。该文章发表在5月21日出版的《科学》杂志上。

“这最初的工作为这个雄心勃勃的计划奠定了基础,对理解至关重要的作用,微生物在人类健康和疾病,”国家卫生研究院主任弗朗西斯•s•科林斯说,医学博士博士。“我们只是在刚开始的时候的有趣的旅程,将改变我们如何诊断、治疗,最终,防止许多疾病。”

在2008年推出的美国国立卫生研究院共同基金的医学研究路线图,高熔点是1.57亿美元,五年的努力,将实施一系列越来越复杂的研究,揭示了微生物在人类健康的互动作用。

178年这个报告启动HMP微生物基因组参考集合,最终将总大约900微生物基因组的细菌,病毒和真菌。这些数据将被使用的高分子聚合物的微生物群落研究人员发现在健康志愿者样品,之后,那些特定的疾病。bet188真人目前正在采集样本进行高分子聚合物从身体的五个领域:消化道、口腔、皮肤、鼻子和阴道。

“尽管这仅仅是第一步在HMP医学上有用,我们已经学会了令人惊讶的关于微生物的多样性和复杂性,住在我们的身体,“简·彼得森说,博士,副主任NHGRI单位以外的人员分工和HMP领导人的努力。“下一阶段的协调研究将开始把特定微生物的存在与否与健康和疾病的各种状态。”

研究人员还进行了一个初步的调查获得的见解的一些新发现基因的功能和蛋白质的微生物菌株。例如,研究人员发现未知的蛋白质产生的细菌生活在胃,可能导致胃溃疡,胃粘膜上的一个洞。此外,他们发现少量的新发现新颖的蛋白质与糖类和氨基酸代谢有关。

研究人员还评估了微生物多样性出现在高熔点参考集合。例如,他们发现29693以前未被发现的,独特的参考集合中蛋白质-蛋白质比有估计基因在人类基因组中。他们相比以前相同数量的微生物基因组测序结果随机选择从公共数据库。在微生物基因组从公共数据库,他们发现14064年的小说《蛋白质。研究人员说,这些数据表明,高熔点参考收集近两倍的微生物多样性是由微生物的基因组已经在公共数据库。

HMP参考集合的主要目标之一是扩大从宏基因组研究人员解释数据的能力。宏基因组研究遗传物质的集合(基因组)从生物的混合社区。比较宏基因组和基因组序列数据参考集合可以帮助研究人员确定是否小说或已经存在的序列。

评估参考基因组的集合是否会议上面的目标中,研究人员将1680万个微生物序列中发现公共数据库HMP参考基因组序列的集合。他们发现62基因组参考集合显示,与1130万年相似的微生物在公共数据库和序列690万-约41%与基因组序列对应参考集合。

这一分析表明,基因组测序作为参考集合的一部分直接添加到一个对人类微生物组的理解。然而,研究人员警告说,至少三分之一的宏基因组序列还没有代表任何基因组参考收集和分析只关注胃肠道。

作者补充说,额外的基因组可能存在于身体的其他网站和参考集合的完成应该解决现存的许多生物不占这一分析。

初始阶段的高分子聚合物,包括目前的研究,集中在细菌,但是未来的基因组测序和人类微生物组研究也将捕获的信息更复杂的微生物和病毒。的努力到目前为止还允许研究人员创建数据资源的框架和标准。此外,该项目是支持创新技术和计算工具的发展,协调数据分析,和考试的一些伦理、法律和社会影响人类微生物组研究。