国家卫生研究院的研究人员发现新的基因影响丙型肝炎病毒的间隙

他们还发现了一种遗传变异在这个基因,干扰素λ4 (IFNL4),预测人们如何应对治疗丙型肝炎感染。这项研究的结果,研究人员在美国国家癌症研究所(NCI),美国国立卫生研究院的一部分,和他们的合作者在NIH和其他机构,发表在自然遗传学在1月6日,2013年。

慢性丙型肝炎病毒感染是引起肝硬化和肝癌。多达80%的人强烈地感染了丙型肝炎病毒无法清除和发展慢性丙型肝炎感染,这些,大约5%患肝癌。个人的非洲血统不响应当前治疗丙型肝炎感染的患者相比,欧洲或亚洲血统。

以前,结果全基因组关联研究(GWAS)识别常见的遗传标记与应对有关丙型肝炎病毒感染的治疗和自发的间隙。这些标记是位于染色体19附近一个已知的干扰素基因,IFNL3。然而,分子调查IFNL3没有解释GWAS与自发的病毒清除或治疗反应。发现新基因,研究人员使用一种技术涉及到人类肝细胞RNA序列模拟丙型肝炎病毒感染治疗。

“通过使用RNA序列我们看上去外框搜索一些超出在这个区域是已知的。我们中了大奖,新基因的发现。可能是其他重要基因可能会发现使用这种方法,“联合首席调查员柳德米拉Prokunina-Olsson博士说,转化基因组学实验室的国家癌症研究所癌症流行病学和遗传学部门的(DCEG)。

研究人员发现,IFNL4地区港口的一个变种,在两种形式。一种形式,称为deltaG,结果在删除组成DNA的四个基地之一。更改创建一个变更称为转移,产生IFNL4蛋白,而没有删除不会产生IFNL4形式。通过分析数据从肝炎C-infected非洲裔和欧裔美国人参与临床研究,作者发现IFNL4蛋白质的存在与贫穷有关间隙比的形式和对治疗的反应不会产生IFNL4。删除变体在非洲血统的人更常见,这可以部分解释为什么非洲裔美国人较低应对当前丙型肝炎治疗的患者比亚洲和欧洲血统。

“我们的工作满足几个基因组时代的承诺,”Thomas r . O ' brien说,NCI的医学博士、感染和Immunoepidemiology分支DCEG。“一、更好的理解生物学;2、个性化医学;第三,新的潜在的治疗方法。我们在前两个立即交付。我们已经确定了一个新的基因,可以帮助我们更好地理解应对病毒感染和新的遗传标记可能过渡到临床实践,因为它预测治疗效果为非洲裔患者比当前的基因测试。第三,INFL4蛋白可能作为一种新型治疗丙型肝炎病毒感染的目标,甚至其他疾病。”

新基因属于现在的一个四口之家interferon-lambda蛋白质编码基因的三个十年多前被发现(IFNL1, IFNL2和IFNL3)的机制IFNL 4蛋白损害丙型肝炎病毒间隙仍然未知。进一步的研究将探讨这部小说的分子功能蛋白在正常和疾病情况。

本研究进行了合作与国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所国家卫生研究院,以及美国食品和药物管理局,和许多大学和研究机构。提供的资金是NCI格兰特Z01 CP005782。