国家卫生研究院的研究人员进行第一个基因组调查人类皮肤真菌的多样性

虽然人类有利用酵母发酵面包和啤酒的力量,酵母或其他类型的真菌的作用,它们生活在人类和身体不是很好理解。人类皮肤真菌多样性在第一项研究中,美国国立卫生研究院的研究人员的DNA测序真菌在皮肤的健康成年人定义整个皮肤和正常人群为调查提供了一个框架真菌皮肤状况。

人类皮肤表面复杂的微生物生态系统,包括真菌、细菌和病毒,统称为皮肤微生物。虽然皮肤真菌感染影响大约2900万人在美国,真菌可以缓慢而难以在实验室生长,甚至复杂的诊断和治疗最常见的真菌性皮肤病,如脚趾甲感染。

国家人类基因组研究所的研究小组(NHGRI)和美国国家癌症研究所(NCI),国家卫生研究院的两个部分,扩展他们的最近的皮肤细菌的基因组测序研究,利用DNA测序技术优化确定真菌。这项研究发表在2013年5月22日,早期在线出版的《自然。

研究人员发现,单一类型的真菌,属于属细胞死亡,主要在头部和躯干。手,港大细菌的多样性,回家种真菌相对较少。相比之下,脚,包括脚趾甲,脚跟和脚趾网包含巨大的多样性。

“应用DNA测序研究皮肤的真菌是自然发展的理解微生物,对我们的身体共存,“说NHGRI科学主任丹尼尔Kastner,医学博士博士”。随着最近的基因组测序来定义细菌多样性,真菌多样性的分析提供了一个更完整的人类微生物组的照片。”

“真菌社区占领复bet188真人杂的领域,即使在人类的身体,”海蒂说,医学博士文章的第二作者,一名调查员在国家癌症研究中心的皮肤科分支。”,获得一个更完整的认识真菌和细菌的生态系统,我们可以更好地解决相关的皮肤病,包括皮肤病可以治疗癌症有关。”

研究人员收集样品在14身体从10健康成人网站。真菌的DNA测序样品确认的DNA片段,叫做系统发育标记,它可以清点,用来区分一种真菌。生成的测序工作超过500万标记,从样本,代表超过80个真菌类型,或属。相比之下,传统的培养方法生产了130殖民地代表只有18真菌属的真菌。

在20%的研究对象,研究人员观察到的问题,如脚跟和脚趾web扩展或脚趾甲变化符合真菌感染。从基因组测序分析,研究人员发现,不同个人跟网站感染常见真菌社区网站,而那些显示非常不同的脚趾甲感染真菌的社区。bet188真人

“DNA测序揭示了伟大的真菌的多样性,甚至那些难以生长在文化,”朱莉塞格雷说,博士,文章的第二作者和高级调查员,NHGRI遗传学和分子生物学的分支。她的专业是微生物DNA测序技术的发展。大大“DNA测序使我们学习更多关于在真菌支配人类皮肤微生物组的一部分。”

研究人员发现真菌从两个类群,子囊菌和担子菌,作为正常的一部分,在14皮肤真菌人口普查网站。最常见的细胞存在于11属14个站点对身体的采样。研究人员发现细胞真菌在每一个健康志愿者的皮肤表面,背面的头,是否在鼻孔和耳朵后面,高跟鞋。高跟鞋也拥有许多额外的真菌,包括属曲霉菌、隐球菌,红酵母,Epicoccum。

“DNA序列的识别方法使我们能够区分物种间的真菌和得出结论,真菌的多样性是高度依赖于身体采样站点而不是人,”香港博士说。皮肤科医生,香港博士解释了为什么选择这些网站探索:“我们的研究集中在区域的皮肤,我们通常发现皮肤病与真菌有关。”

最复杂的网站,鞋跟,拥有大约80 genus-level类型的真菌。研究人员发现约60类型在脚趾甲拭子样本和40个样本中网的脚趾。网站与温和的真菌多样性在弯曲的手臂,前臂和手掌内部,每个位置支持18到32属的真菌。令人惊讶的是,头部和躯干的身体网站——包括后面,脖子,耳朵内部,在耳朵后面,和眉毛之间,拥有更少的真菌类型,只有两个到10个属。

研究团队相比与皮肤细菌真菌多样性数据相同的健康成人。他们发现,虽然武器有很高的细菌多样性的措施,他们真菌多样性较低。他们发现相反的是对网站的脚。身体核心网站既没有高的细菌多样性和高真菌多样性。研究人员先前表明,细菌多样性可以预测是否皮肤潮湿,干燥或油腻。真菌多样性,相反,似乎取决于一个特定的皮肤对身体的网站。

研究人员观察到,此外,有更大的真菌群落结构相似性的左右同一个人的身体相比,相同的身体部位在任何两个人。真菌社区似乎也bet188真人相当稳定,几乎没有改变两次测试时,三个月的时间。

“从我们的研究给了我们一个基线数据正常个体,我们之前从未有过的,”塞格雷博士说。“底线是你的脚与真菌的多样性,所以在更衣室穿你的拖鞋如果你不想将你的脚真菌与别人的真菌。”