NIH绘制基因组变化的肺、脑和卵巢癌

美国国家癌症研究所(NCI)和国家人类基因组研究所(NHGRI)的一部分美国国立卫生研究院的(NIH),已宣布的前三个癌症研究的试点阶段癌症基因组图谱(TCGA)项目。

TCGA的癌症研究试点项目是肺、脑(胶质母细胞瘤),卵巢。

这些癌症,它们占每年有210000癌症病例在美国,被选中的可用性TCGA biospecimen集合符合严格的科学、技术、和道德要求。

”的选择前三个研究的癌症类型,TCGA信号这一行动的科学开始,“国家卫生研究院主任伊莱亚斯说塞,医学博士

“多亏了人类基因组计划开发的工具和技术,科学家可以确定是否可以合作开发一个有用的阿特拉斯的变化与所有类型的癌症相关的人类基因蓝图。”

NCI和TCGA NHGRI推出了2005年12月合作三年试点项目测试使用大规模基因组分析技术的可行性确定所有重要的基因组变化参与了癌症。

当全面运作,TCGA将包括四个集成组件:Biospecimen核心资源(BCR);癌症基因组鉴定中心;基因组测序中心;和一个主要生物信息学资源。

这两个机构还宣布将提供biospecimens的biorepositories前三个癌症研究作为TCGA试点项目的一部分。

肺癌的来源biospecimens将肺癌组织的癌症和白血病B组(CALGB)临床试验,这是位于布莱根波士顿妇女医院的质量。

脑部肿瘤的来源(胶质母细胞瘤)biospecimensMD安德森癌症中心在休斯顿德克萨斯州。

提供的卵巢癌biospecimens将妇科肿瘤组组织银行的儿童医院俄亥俄州立大学俄亥俄州哥伦布市。

NCI和NHGRI也宣布国际基因研究团的一部分,转化基因组学研究所凤凰城,亚利桑那州。被选中的建立和管理,TCGA的BCR。

BCR将收集、存储、处理和分发生物分子从癌变和正常样本的癌症基因组鉴定中心和基因组测序的基因组分析中心。

TCGA的癌症基因组鉴定中心将分析样本BCR识别关键的基因改变,比如拷贝数变化和/或染色体重组,其中一些是已知的导致癌症发展和/或发展。

选择基因将使用高通量测序的基因组测序中心的方法来识别微小的基因改变,如单基地突变和小插入/删除。

TCGA癌症基因组鉴定中心和基因组测序中心将在未来几个月内被选中。

“癌症是非常复杂的,包括超过200种不同的疾病,”注意到代理的美国国家癌症研究所所长约翰·e·Niederhuber医学博士

“TCGA的总体目标是将更深入地研究基因导致这种复杂性的起源,为了使的发现和发展新一代的治疗,诊断和预防癌症的策略。”

“结果TCGA计划项目的早期癌症检测可以提供我们需要的结果,在其最可治疗阶段,并提供新的目标发展的具体治疗方法。”

“癌症基因组图谱将使用尖端技术和知识从人类基因组计划和其他基因组研究评估基因组变化的范围,导致癌症所独有的细胞生长失控,”解释弗朗西斯•s•科林斯国家人类基因组研究所主任,医学博士博士。

TCGA”将与多种技术分析数以百计的肿瘤标本,包括从癌症基因组序列的比较正常的DNA序列来自相同的患者,以识别变化,尤其是与癌症相关的风险。”

TCGA的选择三个癌症研究发现,这个过程开始于2005年的秋天与请求信息(RFI) NCI和通知NCI癌症中心。

RFI的目标是识别候选biospecimen集合采用道德的最高水平,技术、生理、病理和生物信息学biorepository标准的发展。

集合在一个三级资格进行评估的过程。

主要的标准解决最小样本的质量和数量的要求和相关的临床信息。

二级标准被有效地应用于排名这些肿瘤集合符合主要的标准。

网站访问biorepositories然后由NCI和NHGRI员工。TCGA的关键因素,如时间、物流、和re-consent病人的需要,考虑到选择biorepositories的考虑。

最后,biorepositories摆脱这个分层过程由一个专家小组进行进一步审查,包括手术的代表,研究,病理学,生物伦理学,病人的倡导者的社区。bet188真人

的小学,中学,和额外的标准详细描述国家卫生研究院网站。

“癌症基因组图谱试点项目是一个重要的机会,我们调查癌症研究的未来,”道格·阿尔曼说,癌症幸存者,兰斯阿姆斯特朗基金会的使命总监,NCI导演椅的消费者联络小组。

“我们必须抛开我们的特定疾病的兴趣和通道能量较大的问题,可以使癌症研究企业寻找新的方式来改善所有癌症患者的治疗结果。”

TCGA试点项目的成功因素包括完成基因组分析的三个最初的癌症类型;识别特定的改变与癌症相关的基因;基于基因组的变化和分化的癌症亚型。

此外,试点项目将建立一个公开的综合数据库,科学家们可以使用它来生成新的知识通过研究。

TCGA数据将通过公共数据库由国家支持的癌症生物医学信息学网格™(caBIG™)和国家医学图书馆国家生物技术信息中心(NCBI)。

TCGA数据将提供的方式保护和尊重都达到了最高标准的研究参与者。

“癌症基因组图谱是一项革命性的工程与潜在的癌症研究人员提供所需的信息生成新的假设,可以在实验室和临床测试,“说NCI副主任安娜·d·巴克博士。

TCGA”实现的长期目标识别的所有重要的所有癌症基因组的变化将有利于患者通过使分子生物标志物的发现和发展需要制定有针对性的干预措施,以防止和治愈癌症。”