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基于非线性动力学的多数据源集成系统


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非线性动力学公司宣布,它正在开发一个大规模的分析和数据挖掘系统,称为modas平台,它将汇集来自多个应用程序、来源和学科的数据。

正在开发的modas平台将来自不同技术范围的数据整合在一起,例如将1D和2D凝胶数据、质谱仪数据、阵列数据和各种其他基于跟踪的数据整合到一个集成系统中。

这将能够用于各种各样的应用,以支持集成系统生物学方法。

由于所有数据都包含在一个单一的数据库中,在这个单一的数据源上进行分析和挖掘,因此数据将是一致的、可比较的和集成的。创新和先进的工具,如客户端/服务器架构和分布式计算,正在被用于确保从概念上解决可伸缩性、灵活性和广泛用户访问等问题。

非线性动力学集团首席执行官Will Dracup表示:“我们非常清楚,modas平台承诺了很多——但我们很高兴随着时间的推移,我们能够兑现这些承诺。”

“通过我们新的敏捷方法,我们目前为这款产品开发新模块的速度比公司历史上任何时候都要快,我为我们迄今为止取得的成就感到自豪。”

“我们真诚地相信,这个系统将对生命科学研究的进行方式产生重大影响。”

“学科之间存在的历史边界近年来变得更加具体,将显著模糊,使更有效的跨团队协作和系统生物学方法的最终实现成为可能。”

“与我们的合作伙伴和合作者一起,我们期待在尽快实现这一目标方面发挥关键作用。”

该公司通过在慕尼黑举行的HUPO世界年会上发布该平台的第一个版本来支持这些主张。

它被称为modas 2D/MS,是一个用于分析和挖掘2D凝胶和MS数据的集成平台。采用三层系统架构。

它的核心是一个中央数据库,在一个单一的、可扩展的数据源中包含蛋白质组学工作流数据。这个服务器端组件集成了非线性自己的复杂数据库模式,以优化性能。

与这个核心交互的是一系列灵活的客户端模块,统称为modas Desktop。

它们支持整个2D / MS工作流程,例如,记录样品制备数据,构建2D分析实验,使用统计数据处理来寻找感兴趣的蛋白质,并根据蛋白质数据库搜索MS数据。

使用灵活的许可,这些模块可以安装在整个网络中,确保广泛的访问和密切的团队协作。

还有第三层,称为分析代理。这是一种安装在任何数量的远程专用电脑上的复杂软件。

2D凝胶的实际数据处理,即该工作流中耗时且耗费资源的元素,被外包给这些代理,客户端和服务器系统都不受影响,能够继续以最佳方式运行。

这些代理进一步确保了系统的可伸缩性,因为随着吞吐量的增加,客户可以简单地添加更多的代理,而不会影响整体系统性能。

modas 2D/MS旨在采用与非线性Progenesis PG240解决方案相同的分析算法,这是一种先进的商业分析包。

也采用Mascot的引擎进行MS和MS/MS搜索,modas 2D/MS因此被设计为在工具、架构和界面上表现复杂。

非线性动力学集团销售和营销总监兼非线性美国公司首席执行官John Spreadbury说:“这个强大的客户端服务器产品是多年密集工作的结果,它是一个用于分析、存储和挖掘生命科学数据的完全集成平台。”

“考虑到它的规模、功能和尖端性质,用户认为这将是一个昂贵的解决方案是可以理解的。不过,我们很高兴地宣布,我们的定价将极具竞争力,我们的系统配置非常灵活。”

“我们预计这个系统会有很高的需求,并希望让尽可能多的用户可以使用它。因此,modas 2D/MS有望彻底改变整个市场开展蛋白质组学研究的方式。”

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