新方法揭示药物靶点

维尔康姆基金会桑格研究所的科学家们已经开发出一种新的大规模的方法来识别蛋白质之间的相互作用是一个主要的治疗目标。

新方法可以识别弱,短暂的交互特性的细胞反应的线索从内部环境或身体。

细胞表面蛋白质是许多药物和中央的目标很多细胞调节的过程,比如一些癌症疗法,糖尿病,和增长。团队希望这个方法能发现许多重要的相互作用,是看不见的电流检测方法。

许多蛋白质分子开关,作为响应信号,激活特定基因或特定细胞的过程。用生化手段增加检测瞬态和弱的可能性,但潜在的重要的是,交互作用,科学家们描述17新对哺乳动物细胞的相互作用。

“我们的新方法将大规模搜索这些重要的相互作用。”

不像DNA测序方法是常见的所有生物,没有一种方法,让全球适合所有不同的蛋白质相互作用。的新方法,称为AVEXIS,应适用于在许多生物体相互作用在细胞表面。

我们的新方法将大规模搜索重要,瞬态和弱相互作用在细胞表面。

加文·赖特博士”如果一个基因组是生命的代码,蛋白质之间的相互作用是通信系统——互联网我们的身体,“加文·赖特博士解释说,初级调查员维尔康姆基金会桑格研究所。“我们面临的挑战是,当前的方法不能有效地检测交互通信的地方开始:细胞表面,也不能可靠地检测瞬态弱相互作用。”

药物靶点往往蛋白质表面的细胞,因为它们易于接近我们的细胞内药物与蛋白质。不幸的是,当前目录已知蛋白质的相互作用是偏离这些蛋白质仅仅因为没有有效的方法来检查它们。有效,一系列的临床研究的重要目标是无形的。

“AVEXIS现在允许我们寻找规模生物和临床重要的蛋白质-蛋白质之间的关系,”赖特博士继续。“这些交互是像维可牢®——每个钩只能绑定弱,但在一起,他们可以有很强的效果。我们一起的力量增加了收集的蛋白质,作为在一个小的维可牢®。”

Gavin WrightThe博士团队确认之前从未描述的交互类的蛋白质被称为免疫球蛋白超科:这组蛋白质股票重要属性允许细胞响应他们的环境,和另一个粘在一起。使用人类的蛋白质和斑马鱼作为模型,桑格研究所的研究人员观察了110个蛋白质之间的相互作用在这个总科,共有超过6000的实验。

他们发现17交互符合严格的标准的可靠性,其中一些会在细胞持续小于0.1秒。对于每一个,他们看起来蛋白质分布在斑马鱼胚胎。他们发现,广泛,两类;的两个蛋白伴侣出现在相同的组织(并可能参与细胞粘附),它们出现在相邻的组织(因此可能参与组织)之间的通信。一半的蛋白质与多个其他蛋白质相互作用,形成交互网络。

结果提供低亲和力的第一网络之间的相互作用蛋白质在细胞表面和第一组斑马鱼的大量的数据,后主要生物视觉基因中断的影响。

“AVEXIS并不局限于只有一个特定的生物和可以使用在许多情况下,“莱特博士解释说。“我们发现在斑马鱼小说对研究蛋白质相互作用,可以预计,我们将能够同样丰富我们对人类蛋白质相互作用的理解。”

“这部小说交互可以直接导致蛋白质分布的研究模式和目标的候选药物。如果一个互动缺乏一个组件是一种疾病,那么一个可以寻求发现小分子或抗体,将刺激网络的缺失或功能失调的蛋白质会活跃。”