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小说Multiomics方法揭示为什么流感严重性不同个体间

卡通展示病毒颗粒可以在人与人之间传播在密切接触。
各种因素在个体之间的疾病严重程度的变化。信贷:罗伯·索托插图。

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你有没有想过为什么有些人比其他人可能会加重,甚至当他们发现同样的病毒吗?目前尚不清楚这是为什么。病毒因素(如病毒)的应变的差异在这个变化中发挥作用,但是他们不能解释各种不同个体的反应同样感染了病毒。大量的宿主因素也被认为是,包括已有的免疫力,年龄,性别,体重,和微生物。


另一个重要的因素是你的细胞内分子生物学。DNA双螺旋链显示为一个长。所以,你可能会认为,细胞总是读遗传信息,从一端开始,到另一个。但这并不是如此。DNA包含转座的元素,有时被称为“垃圾DNA”,可以改变的基因组区域正在读在给定的时间。


这项工作发表在细胞基因组学博士领导的一个国际研究小组。Guillaume Bourque转位因子,研究这些疾病的严重性后甲型流感病毒感染。

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通过检查数据从39个人之前和之后感染甲型流感病毒,研究人员能够识别可访问性的变化(即“可读性”)转位因子的。要做到这一点,研究人员使用一种方法结合各种套multiomics数据,描述和量化生物分子在细胞或生物体的集合。一个转录组,包括所有副本的RNA转录DNA在细胞中。另一个是表观基因组,是集修改基因表达的DNA的化学变化。这种multiomics方法的一个优势是,他们能够识别家庭转位因子的可访问性的变化,可能会被错过了之前的方法。


通过考虑这些变化在病毒感染后转位因子,他们可以识别一些转录因子(蛋白质,使特定的基因“打开”或“关闭”),可能导致有人对感染的反应。使用这些发现,研究人员能够创建一个模型,可以预测一个人的甲型流感感染后病毒载量。


“许多问题依然存在,如转座因子之间的联系是否和病毒载量是因果和这些变化是否一致的随着时间的推移,”作者说荀陈。”,但这些发现是一个重要的一步了解这些因素的作用在疾病严重性的可变性个体。”


参考:陈X,奶嘴,转座因子Aracena KA, et al。应对流感感染相关的变量。细胞基因组学。杂志2023;3 (5):100292。doi:10.1016 / j.xgen.2023.100292


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