NuGEN科学家屏幕400 +单基因融合事件分析

科学家NuGEN技术,公司同时也调查了超过400个目标基因的RNA在单个试验,使用新一代测序(上天)检测融合已知在几个癌症肿瘤发展的主要推动力。科学家们,他们雇佣了一个创新的方法目标序列库准备,还发现低频融合,以前从未被报道。

新方法,它允许多个同时审讯,特定的RNA基因测序,大大简化了融合检测与标准相比RNA序列的方法。

基于NuGEN单一引物浓缩技术(SPET),“这种方法可以大大提高科学家的理解潜在的致癌能力对基因调控的影响,”据伊丽莎白·赫特NuGEN CEO。”应用程序基于这个激动人心的新技术的承诺加速癌症研究和导致更有效的诊断和治疗,有助于实现精密医学。”

科学家们利用新方法癌和正常组织样本准备有针对性的RNA序列。目的是检测基因的存在已经连接在一起或“融合”产生的基因调控的变化。通过门店,科学家们能够识别多个已知的和以前未报告的从用来进行融合,formalin-fixed石蜡包埋组织(FFPE)。通过瞄准特定的rna序列,科学家们的报告,他们能够减少测序读和增加基因融合检测的敏感性,与标准相比RNA-Seq方法。

“传统方法需要大量的测序读为了检测融合事件背景的20000记录,”道格拉斯Amorese说NuGEN研发副总裁。“其他集中方法不能调查整个剧目先前公认的融合;他们是有限的检测少量的潜在事件。”

此外,科学家们写道,“SPET-based化验很容易使用,RNA输入要求较低,可以使用从formalin-fixed RNA,石蜡包埋(FFPE)组织,这是重要的临床相关的样本。试验是完全可定制的目标任何基因组基因或一组基因。”

博士Bastiaan上衣,荷兰内梅亨大学医学中心人类遗传学的主要发布会上近日报道,他的团队用NuGEN定制基因融合小组分析具体gene-rearrangements肉瘤——发现两个未知的融合。团队,在实验室肿瘤遗传学大学病理学系的计划寻找那些融合在额外的肉瘤样。“我们的最终目标是利用这些基因融合板分子肉瘤的诊断测试,”上说。

样品制备产品的新技术是一分之一套件NuGEN继续发展的新的科学共享分子机制了解癌症起源于不同的组织,根据Amorese。虽然肿瘤可能起源于特定的器官,所涉及的分子机制或改变在癌症的其他地方可能也扮演了一定的角色。(例如,某些乳腺癌和卵巢癌表现出类似的基因变化)。这意味着有效疗法在治疗一种类型的肿瘤也可能是有用的在治疗其他肿瘤表现出类似的分子变化。

提供易于使用的试剂盒,新方法将使用最初的研究人员和临床肿瘤学家发现基因的角色融合在很多类型的癌症和最终用于分子诊断产品指导治疗。制药公司也会使用它来开发、测试和预测个人癌症患者具体疗法的疗效。

Amorese新的SPET方法比作“一个显微镜与更大的权力来检测融合比以往一直可用。现在你可以寻找潜在融合事件中数以百计的已知基因与肿瘤很容易可以看单个基因。测试集中在一小部分潜在的融合会产生误导,未能利用第二代测序的力量。这些测试仅仅是皮毛,它与细胞中理解正在发生的事情,”Amorese说。