PacBio和新加坡GIS扩大传染病合作

A*STAR的新加坡基因组研究所(GIS)最近扩大了与太平洋生物科学公司(PacBio)的合作，PacBio是一家总部位于加州的PacBio®RS II测序系统提供商，基于新颖的单分子实时(SMRT)技术。

这项合作建立在GIS和PacBio在分析和理解细菌和病毒方面的互补优势之上，包括导致腹泻、脑膜炎、尿路感染、登革热和肝癌等疾病的细菌和病毒，以及那些我们持续生活在一起的细菌和病毒，称为微生物群。了解细菌基因组的动态对解决新加坡和世界其他地区日益增长的抗生素耐药性挑战特别重要。

来自GIS的Swaine Chen博士、Martin Hibberd博士和Niranjan Nagarajan博士是此次合作的带头人。陈博士说:“与PacBio合作，我们能够对细菌基因组进行完全测序，并对细菌如何导致疾病有更深入的了解。”

这次最新的合作扩展了之前与PacBio的合作。今年早些时候，陈博士和Hibberd博士完成了与PacBio公司的初步正式合作，该合作为大肠杆菌如何导致尿路感染提供了见解，其结果预计将于今年晚些时候发表。

太平洋生物科学亚太区总裁兼总经理Ram Laxman评论道:“SMRT®测序技术被证明是细菌和病毒测序的金标准，因为它能够完全解析重复区域并“完成”基因组。其他NGS技术由于其序列上下文偏差和非常短的测序读数，甚至无法完成最小的细菌基因组。这就像试图用缺失的拼图来完成一个复杂的拼图。”他还补充说，研究人员开始使用PacBio RS II来跟踪导致中东呼吸综合征等大流行的病毒突变。快速的周转时间，加上最高的共识测序准确性，对于跟踪这些病毒的传播和突变率至关重要。

Pacific Biosciences的总裁兼首席执行官Michael Hunkapiller评论说:“我们看到了与GIS等世界知名机构合作的巨大潜力，可以进一步扩大SMRT测序的应用，特别是那些对人类健康有直接影响的应用。”

GIS执行董事吴哈克辉教授说:“这次与PacBio®的扩大合作使我们能够进一步研究改善新加坡的公共医疗保健。通过对细菌基因组的更深入了解，我们可以有效地应对常见的传染病和抗生素耐药性，从而为患者带来更好的治疗结果。”