帕洛阿尔托研究中心团队购买Illumina公司基因分型解决方案

Illumina公司,公司已经宣布,它已经签署了一项协议与儿童医院奥克兰研究所(CHORI)提供试剂和仪器研究旨在确定单核苷酸多态性(snp)的影响个人对他汀类药物,一种广泛使用的降胆固醇药物。

这项研究正在进行,nih资助研究项目的一部分,药物基因组学和心血管疾病的风险(帕洛阿尔托研究中心)。

当前五年年底格兰特时期,帕洛阿尔托研究中心旨在识别关键基因对他汀类药物治疗的决定因素由卫生保健提供者可以使用,以确保最好的心血管结果和治疗每个病人的风险最低。

帕洛阿尔托研究中心的首席研究员领导的研究项目是罗纳德•克劳斯M。D, CHORI高级科学家和动脉粥样硬化的研究主任。

实验计划将研究划分为四个连续的阶段,以确保足够的统计能力,减少假阳性结果的风险识别与他汀类药物相关的信息最丰富的单核苷酸多态性反应和临床心脏端点。

他汀类药物反应评估表型包括低密度脂蛋白和高密度脂蛋白水平和他们的小分支,指数胆固醇的合成和吸收,和炎症标记物。

研究还旨在识别单核苷酸多态性与statin-related肌病,一种不常见的副作用表现为受损的肌肉。

样品多用于所有阶段将在Nickerson博士的实验室进行全自动Illumina公司BeadStation系统和四个租赁Illumina公司BeadArray读者适应样品处理量在项目进度计划。

样品将来自大型临床试验之前进行的调查人员在帕洛阿尔托研究中心和其他他汀类药物的研究项目,已经测试了影响辛伐他汀,普伐他汀、普伐和阿托伐他汀在实验室和临床心血管疾病风险的措施。

第一阶段将涉及一千多个临床样本的全基因组关联分析使用Sentrix®Human-1 BeadChip和后续Sentrix HumanHap-1 BeadChip可以查询超过250000 TagSNPs源自国际人类基因组单体型图计划。

这项研究将使用Illumina公司的英飞纳姆™试验,使几乎所有的聪明的选择和分析基因组SNP,提供覆盖和多路复用的水平是有限的,只有在BeadChip特征的数量。

英飞纳姆性能,以调用速度,准确性和重现性,是与Illumina公司GoldenGate®试验协议,人类基因组单体型图计划的黄金标准。

后确认分析的阶段我发现额外的临床样本和军团,后续阶段将系统地评估单体型,每个块内的特定单,单核苷酸多态性在这些单确定最有益的变异和那些有因果联系的临床表型。

超过10000个样品将在后者阶段的测试项目,将采用细映射技术使用Illumina公司GoldenGate试验协议,SNP标记的自定义面板,Sentrix通用阵列矩阵。

评论这项研究中,克劳斯博士说:“这个项目将成为第一个充分利用人类基因组单体型图数据精简全基因组分析。”

“新的基因分型的工具将使研究小组在经济上进行大规模、multicohort-designed实验和交付成果有意义的价值诊所。”

“我们期待与Illumina公司在这个项目中,我们认为的设计将作为模型药物基因组学的研究范围广泛的疾病。”

根据杰弗,Illumina公司总裁兼首席执行官,“我们与帕洛阿尔托研究中心的研究人员感到非常兴奋和高兴,我们的基因分型解决方案将有助于这个开创性的研究。”

“这是这种研究将演示药物基因组学的好处和燃料发展个性化医疗。”