宾夕法尼亚大学医学生物化学家获得重大奖项表观遗传研究蛋白质通过质量规范的修改

本杰明。加西亚博士,定量蛋白质组学方面的专家教授和总统的佩雷尔曼医学院生物化学和生物物理学在宾夕法尼亚大学,Biemann奖章授予了美国社会质谱(asm)。青年奖在基础研究或应用质谱识别重大成就。

加西亚的实验室已经开发和提炼分析蛋白质的质谱分析技术被认为是艺术和全球研究人员使用。蛋白质,修改他们,他们的各种形式的细胞机制的驱动力控制至关重要的生理活动。

质谱技术检测样本的组件——固体、液体或气体的质量和电荷。它可以确定哪些分子组成一个示例基于光谱产生的离子。这个过程可以检测蛋白质和生物标志物(化学标志某种疾病),并使其结构的研究,特别是在低浓度。应用于照顾病人在诊断测试,包括分析蛋白监测药物治疗的有效性,并确定引起疾病的靶向治疗。

加西亚被认为组蛋白的贡献更好的理解代码,修改设置的组蛋白蛋白质调节基因表达的关键。在人类和其他动物,组蛋白函数作为DNA线型卷包装本身。他们扮演着重要角色在正常细胞分裂,这是生命的必需品,但他们也参与细胞的发展和推动某些癌症。大多数蛋白质一旦翻译进行修改,这些修改规定他们的细胞功能。

加西亚的实验室已经开发了大量的实验和计算方法来检测组蛋白转录后修饰,量化它们的相对丰度,监控其inter-cellular活动,并修改特定基因精确定位。特别是,加西亚开创了高通量,“自下而上”的方法来检测翻译后组蛋白修饰和多个细胞状态的定量比较。(指的高通量DNA测序大量来自许多不同的人。)他的专长还包括“中产”的方法,使组蛋白proteoforms的详细分析,与并发组蛋白发生修改。

在自下而上和middle-down方法中,一个关键的目标是利用大量的protein-centered数据以改进的理解生物过程如转录后修饰在分子水平上,帮助阐明各种疾病并最终确定治疗的机制。例如,目前未知的什么影响,如果有的话,组蛋白修饰的多个组合可能产生。复杂的质谱分析由加西亚这样的组蛋白修饰是提高调查到一个更高的规模。结合细胞和生化实验,生物信息学分析,和其他技术,它可以创建一个系统生物学发展前景奠定了基础,为许多人类疾病的药物治疗。

加西亚承认社会说:“这些方法取得了独特影响染色质(染色体)生物学和表观遗传学研究[开关基因的生物学机制研究和关闭),并已全面融入越来越多的研究小组来自世界各地。”

建立Biemann奖章是为了纪念已故的教授克劳斯Biemann麻省理工学院的技术。它将被正式授予6月在圣地亚哥的asm年会;加西亚将讲座活动。

加西亚收到了他从加州大学戴维斯分校的单身汉在化学和他在夏洛茨维尔弗吉尼亚大学的化学博士学位。

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