pharaddesign和CBRC开发软件来预测蛋白质中的紊乱区域
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phmadesign公司和蛋白质功能团队领导的Tamotsu Noguchi博士计算生物学研究中心(银监会)国家先进工业科学技术研究所(AIST)开发了POODLE _预测有序和无序的机器学习_,一种预测蛋白质中无序区域(不形成某种三维结构的氨基酸序列)的方法。
与现有方法相比,POODLE在无序区预测方面具有较高的准确性,将使x射线晶体学和核磁共振分析等蛋白质结构分析有效。
众所周知,蛋白质需要形成其独特的三维结构才能与其他分子相互作用并正常工作。
然而,实验证明,一些不形成某些三维结构的序列(因此称为无序区域或原生展开区域)在高等生物中发挥着重要作用。
其中许多已在参与基因转录和DNA结合蛋白的蛋白质中被发现。
因此,在理解蛋白质功能方面,揭示紊乱区域及其功能之间的关系被认为是非常重要的。
此外,由于已知无序区域会阻止结晶和光谱分配,因此事先去除它们将使分析更加容易。
因此,准确预测失序区域在蛋白质的结构和功能分析中变得非常重要。
贵宾犬将在网上免费提供银监会的网站从2006年8月10日开始,它的现场版本将在今年秋天从PharmaDesign上市。
PharmaDesign将开始合同研究服务,使用POODLE和其他一些程序来识别疾病区域。
PharmaDesign还计划在今年12月发布一个肽库,用于基于相同紊乱区域预测的药物发现。
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