潜力Anti-Chagas疗法使用基于结构的药物设计
恰加斯病是一种潜在的威胁生命的疾病引起的寄生虫,鲁兹锥体,通过锥蝽吸血昆虫传染给人类,通常被称为“接吻错误”或“吸血鬼bug”。虽然它曾经是局限于美洲,全球旅游传播疾病,这是现在流行约20个国家。目前,世界卫生组织(世卫组织)估计,10 - 13几百万人慢性感染,约有9000万人受感染的风险,而且几乎每年有21000人死于与结果,使有效的治疗是必要的。目前的治疗主要是有效的在第一阶段(急性)的感染,但显著降低功效在随后的阶段(慢性)恰加斯病。此外,这些药物,是在60年代,伴有严重的负面影响。
Masakazu Sekijima先进计算药物发现的单位,在东京技术,清北城的长崎大学热带医学学院和全球卫生和同事利用综合集成的方法来开发潜在的新anti-Chagas疗法相结合的原则,基于结构的药物设计,在治疗目标设计与知识的三维(3 d)结构在体外(通俗称为“试管实验”)测试方法,和x射线晶体学。这种方法更有效地缩小候选药物的范围。通过虚拟筛选TSUBAME东京理工大学,世界上最大的之一,大型超级计算机,他们选定的目标蛋白质,t . cruzi亚精胺合成酶,基于特定的结构特点和属性表明其重要性在另一个锥体虫属的物种的生存。如果一个物种的生存所需的蛋白质,抑制蛋白质可能是一个潜在的药物作用机理与活动导致恰加斯病的寄生虫。
他们专注于亚精胺合成酶(SpdSyn)作为目标蛋白质,作为来自iNTRODB系统。这个系统是由教授Yutaka秋山,Takashi石田计算机科学系,教授在东京技术,和热带医学学院的清基塔教授在长崎大学全球健康。详细的信息关于搜索方法如图1所示。内部web系统iNTRODB促进药物的选择目标蛋白质被忽略的,特别是对锥虫病。这个系统提供了信息trypanosomal蛋白质与有用的注释,包括蛋白质结构的蛋白质数据库(PDB)和蛋白质从ChEMBL抑制剂。
选择后,确定了潜在的候选药物抑制剂通过筛选搜索称为对接仿真,基于结构的药物设计方法使用3 d模拟计算药物化合物SpdSyn相匹配。他们成功地鉴定出四种药物类化合物是虚拟的“匹配”(称为“点击率”)然后评估他们的抑制活性在体外和比较结果与积极的控制。进一步测试潜在的活动和约束力,他们使用x射线晶体学来确认这四个化合物与蛋白质结构复杂。通过交互分析每个化合物的研究人员发现,这四个化合物与该目标通过相同的氨基酸结合位点,Asp171。此外,分子模拟显示额外的互动网站为每个化合物没有对接仿真预测的。
Sekijima和团队相信,他们的研究结果表明保证对接仿真适用于识别潜在的目标蛋白质和药物类抑制剂治疗恰加斯病。他们希望展示他们的方法的普遍适用性,打开门发现治疗其他疾病。
本文从提供的材料已经再版东京技术学院的。注:材料可能是长度和内容的编辑。为进一步的信息,请联系引用源。
