强大的新方法来生成蛋白质药物

一组科学家创造了一个强大的新方法来生成蛋白质药物。使用电脑,他们设计了分子可以目标重要的蛋白质在体内,胰岛素受体等,以及脆弱蛋白质表面的病毒。这解决了一个长期的挑战在药物开发和可能导致新的治疗癌症、糖尿病、感染、炎症、甚至更远。

这项研究,今天出现在杂志上自然,是由科学家们在实验室里大卫•贝克华盛顿大学的生物化学教授医学院和接受者的2021年生命科学突破奖。

”产生新的蛋白质的能力紧密结合,特别是任何分子的目标,你想要的是一个更广泛的药物开发和分子生物学范式转变,”贝克说。

抗体是当今最常见的蛋白质药物。他们通常通过绑定到一个特定的分子目标函数,然后将激活或停用。抗体可以治疗多种疾病,包括COVID-19和癌症,但生成新的挑战。抗体也可以昂贵的制造。

贝克两位博士后学者领导的研究小组在实验室,龙兴曹和布莱恩考文垂,结合计算蛋白质设计领域的最新进展到达的策略创建新的分子靶点结合的蛋白质的方式类似于抗体。他们开发的软件可以扫描目标分子,识别潜在的结合位点,生成蛋白质定位这些网站,然后屏幕从数以百万计的候选人结合蛋白识别那些最有可能的功能。

该团队使用新软件生成的高亲和性结合蛋白对12个不同的分子靶点。这些目标包括重要的细胞受体如TrkA、表皮生长因子受体,Tie2,和胰岛素受体蛋白质表面的流感病毒和SARS-CoV-2导致COVID-19(病毒)。

“谈到创造新的药物,有简单的目标和努力的目标,“曹说,现在在西湖大学助理教授。”在这篇文章中,我们表明,即使很努力目标是适合这种方法。我们可以让一些目标结合蛋白没有约束力的合作伙伴或抗体,”

总的来说,团队生产超过一百万候选人结合蛋白的12选定的分子靶点。收集的数据在这个庞大的候选人结合蛋白是用来改善整体的方法。

“我们期待看到这些分子如何在临床环境中使用,更重要的是如何设计蛋白质药物的新方法可能导致更有前途的化合物在未来,“考文垂说。

参考:曹L,考文垂B, Goreshnik我,等。设计目标蛋白结合蛋白的结构。自然。2022年。doi:10.1038 / s41586 - 022 - 04654 - 9

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