预测原核RNA-Silencing系统

一项研究发表在开放获取期刊的同行评审系统,生物学直接,提供了第一个强有力的证据表明,一种串联重复序列中发现古菌和细菌,经常聚集空间短回文重复(CRISPR),可能会同CRISPR-associated (cas)家族的基因作为防御机制对噬菌体和质粒RNA。

中科院很多蛋白质包含域所示表明功能相似真核蛋白质参与真核核糖核酸干扰系统。

基拉Makarova和领导的一组其他成员,尤金·库宁的美国国立卫生研究院的美国的贝塞斯达,CRISPR和中科院基因的比较基因组分析古细菌和细菌基因组序列检索从国家生物技术信息中心(NCBI)数据库。

Makarova等人发现了一个中科院的基因数量总是靠近CRISPR集群和编码蛋白可能参与rna加工机制如解除和裂开。

这些蛋白质可能在功能上类似于真核酶参与了rna干扰系统——Makarova等人识别的模拟真核蛋白质RNAi帽子和一些潜在的类似物真核RNAi蛋白质切片机。

但它们不是同源帽子和切片机没有序列相似性。

它已经表明,插入CRISPR单位的比例是相似的病毒或质粒基因组片段。

Makarova等人扩展这些观察和建议所有CRISPR插入来自病毒或质粒,但这并不是显而易见的,因为大多数的这些代理仍然未知。

他们推测,插入转录沉默噬菌体和质粒序列通过一套复式的形成,然后由中科院蛋白质裂解摧毁外国RNA。