通过微阵列分析BRCA1基因的转录组和ChIP-chip分析

文摘
BRCA1基因的作用在直接和间接调节转录。然而,一个全面的观点BRCA1影响转录调控的程度在全基因组水平上没有定义。我们进行全基因组表达分析和ChIP-chip分析,其中比较显示,尽管BRCA1损耗导致转录变化1294个基因,只有44这些启动子受BRCA1。然而,27%的这些记录与转录调控可能解释大量的间接转录变化观察到微阵列分析。我们表明,没有具体的共识序列存在BRCA1 DNA结合,而是证明存在已知的和新颖的转录因子(TF)——绑定网站常见BRCA1启动子。Co-immunoprecipitations证实BRCA1与这些TFs包括AP2-α,我们和ZF5。最后,我们表明,BRCA1绑定到一个子集不改变BRCA1基因启动子的损失,但转录BRCA1-dependent调控DNA损伤。

这篇文章发表在核酸研究和是免费访问。