COVID-19病人的血液中蛋白质可以帮助预测他们会生病

弗朗西斯·克里克研究所的研究人员和柏林夏洛——夏洛蒂已经确定了27个蛋白质生物标记物,可以用来预测COVID-19患者是否可能成为重症疾病。

感染者SARS-CoV-2,病毒导致COVID-19,有不同的反应。一些不出现任何症状,需要住院,对一些人来说,这种疾病是致命的。

在这项研究中,发表在电池系统,研究人员发现27个潜在生物标记出现在不同级别COVID-19患者,根据他们的症状的严重程度。标记可以帮助医生预测疾病患者将成为,为科学家提供了药物开发的新目标。

研究人员提炼一个叫做质谱快速分析方法测试各种蛋白质的存在和数量在血浆中。这个平台是弗朗西斯·克里克研究所开发的,应用于分析31 COVID-19患者的血清在柏林大学医院查利特。结果进一步验证了17个COVID-19患者在同一家医院和15个健康的人。

研究人员希望他们的研究结果将导致开发简单的常规测试,以检查这些蛋白质的水平,一个或一些COVID-19患者。这些测试的结果可以用来决定治疗的医生给的支持。

Christoph Messner主要作者之一,博士后克里克代谢的分子生物学实验室,说:“一个测试来帮助医生预测COVID-19病人是否可能成为关键与否将是无价的。这将帮助他们做出决定如何最好地管理每个病人的疾病以及发现那些高危人群。我们希望我们确定的生物标记的发展将导致这些测试必不可少的。”

三个团队的关键蛋白质识别与白介素有关il - 6,蛋白质导致炎症,一个已知的严重症状的标志。研究人员认为它可能会缓解这些症状用药物,针对这些相关的蛋白质。

马库斯Ralser,论文作者和组长克里克和查利特,说:“鲁棒方法我们在这项研究中的应用是一个有价值的和强大的工具来预测疾病进展和发现潜在的治疗目标。我们的方法也可以很容易应用于其他疾病,在现在和未来,了解更多关于他们的对身体的影响。”

瓦迪姆Demichev,另一个作者和科学家克里克代谢的分子生物学实验室补充道,“而我们技术平台并不是专为COVID-19开发的,它已经被证明非常有用这种疾病获得新颖的见解。我们希望这将有助于预后的分析测试的开发范围广泛的条件在不久的将来”。

所有协议和软件实现这种方法都是免费。*

笔记

*的原始数据获得商业血浆和血清控制GS研究中的样品提交给ProteomeXchange财团通过骄傲(Perez-Riverol et al ., 2019)合伙人PXD018874库与数据集标识符。

根据GenerationScotland参与者的同意条款,对个体层面的数据的访问(组学和表型)必须由委员会GS访问。应用程序应该access@generationscotland.org。

DIA-NN软件套件和黛安R包是开源和免费下载分别在这里和这里。

参考:Messner, c, B。Demichev, V。Wendisch D。Michalick, L。,白色,M。Freiwald,。,。Ralser, m (2020)。超高度大规模临床蛋白质组学揭示COVID-19感染的分类器。电池系统。doi: 10.1016 / j.cels.2020.05.012

本文从以下转载材料。注:材料可能是长度和内容的编辑。为进一步的信息,请联系引用源。