微生物基因组试剂盒加入财团映射

试剂盒已宣布一家植根于与威尔康奈尔医学研究在全球寻求合作的见解流行的病原体,包括抗菌素耐药性,在城市环境中。开始,研究人员将同时收集DNA和RNA样本临街的房间在地铁系统中,公共汽车和54个世界各地的城市公园——扩大微生物宏基因组的画像在纽约地铁于2015年出版。该项目将使用试剂盒样本技术和图书馆准备工作流来提取和准备基因材料进行分析。

”映射在六大洲的看不见的基因组和表观基因组而城市是一个令人激动的工作,说明了潜在的宏基因组创建新的洞察人类之间的交互,我们的环境和微生物对我们的健康产生影响,”科林男爵说,高级主管和试剂盒产品管理负责人总会在生命科学。“试剂盒是喜欢这种国际合作的科学领袖选择我们莫生物PowerSoil®技术包样品提取和QIAseq FX DNA库准备工具,使可靠的新一代测序。”

克里斯托弗·e·梅森博士,副教授生理学和生物物理学和计算在计算生物医学基因组学阿尔瓦利德•本•塔拉尔王子殿下阿卜杜勒阿齐兹•本•沙特威尔康奈尔医学、计算生物医学研究所首席研究员在研究中,与其他同事合作机构和MetaSUB财团,由54成员城市。

“就像我们PathoMap研究创建了一个概要的纽约metagenome基于公交领域,MetaSUB研究者和实验室将致力于在全球范围内建立一个微生物的DNA地图地铁和其他运输系统,”梅森博士说。“这五年承诺将产生抗菌素耐药性在城市地区,导致新发现的生物合成基因簇揭示微生物与环境的相互作用。样品制备和库制备的试剂盒是关键步骤在这个分析中,我们期待重大的发现出现,有利于科学认识和公众的健康。”

MetaSUB团队收集的样本地铁和其他城市网站同步与全球海洋取样一天提供一个“基因快照”的世界城市和海洋在同一时间。在一些城市如纽约、波士顿和蒙得维的亚,宏基因组数据也将从下水道系统生成和海滩和其他环境的研究结果。数据,方法,技术和结果都将对公众开放,免费使用。

一个相关的项目将看宏基因组的影响在里约热内卢奥运会在2016年8月,MetaSub称之为“自然实验”说明全球人类迁徙事件。来自世界各地的估计有500000人将参加8月份的奥运会。抽样的RNA和DNA之前,期间和之后奥运会将包括一个搜索RNA病毒如流感和Zika病毒。MetaSUB研究是“探索大挑战”项目的一个赢家,比尔和梅林达•盖茨基金会的倡议,旨在促进创新来解决关键的全球健康和发展问题。

一定数量的公共资助机构,其他基金会和公司也支持或合作的努力。促进微生物的理解——复杂的微生物含量,如在人类肠道或许多生命科学的环境——目前的目标是使用试剂盒技术的资金计划,包括国家微生物组计划(敝中断)本月早些时候公布的白宫。

32个国家目前的城市参加MetaSUB财团:阿根廷布宜诺斯艾利斯(),澳大利亚(悉尼),奥地利(维也纳),巴西(小溪Preto,力拓达,和圣保罗)智利(圣地亚哥)、中国(北京、广州、香港、上海),哥伦比亚波哥大,克罗地亚萨格勒布,埃及(开罗),法国(马赛和巴黎),德国(柏林),印度(海德拉巴和新德里)、伊朗(德黑兰),意大利(罗马),日本(东京和仙台),墨西哥(墨西哥城),新西兰奥克兰(市)、尼日利亚(台和拉各斯)、挪威(奥斯陆)、葡萄牙(里斯本、波尔图)、卡塔尔(多哈)、俄罗斯(莫斯科),新加坡(新加坡)、南非(约翰内斯堡),韩国(首尔),西班牙(巴塞罗那)、瑞典(斯德哥尔摩),瑞士(苏黎世)、土耳其(伊兹密尔),英国(谢菲尔德和伦敦),乌拉圭蒙得维的亚,美国(巴尔的摩、波士顿、芝加哥、丹佛、费尔班克斯,纽约市,萨克拉门托,旧金山、西雅图和华盛顿特区)。