研究人员组装第二非人类灵长类动物基因组

国家人类基因组研究所(NHGRI),美国国立卫生研究院之一(国家卫生研究院),宣布一个多中心的团队已经把草案基因组序列的恒河猕猴猴到免费的公共数据库中,供全球研究社区使用。

恒河猕猴(“解剖”)是第二个非人类的灵长类动物,黑猩猩(“黑猩猩”)后,它的基因组测序,是第一个旧世界猴DNA破译。

总的来说,恒河猴基因组股份约95%到92的序列与人类(“智人”)和98%以上的黑猩猩。

因此,恒河间的比较提供了一个理想的参考点的三个密切相关的灵长类动物。基因组的测序也进行许多其他灵长类动物,包括猩猩,绒猴和大猩猩。

中使用的DNA样本测序来自雌性恒河猕猴在圣安东尼奥西南生物医学研究基金会。

独立组件的恒河猴基因组数据进行了三种测序中心使用不同的和互补的方法。

领导的研究小组格兰杰萨顿博士j·克雷格·文特尔研究所,然后加入结果数据到一个单独的,高密度的草稿,或“融合大会”。

此协作风险还利用现有资源:人类基因组参考序列,发表恒河DNA映射资源和恒河的DNA指纹数据库迈克尔·史密斯基因组科学中心在不列颠哥伦比亚癌症研究中心在温哥华。

新的高质量的组装,涵盖恒河猴基因组的93%,将使研究人员能够使进化的比较和准确的对这一重要的生物基因预测。

因为它的遗传、生理和代谢与人类相似,恒河猕猴是主要的,非人类的灵长类动物用于人类疾病的研究,以及作为药物开发的一个重要系统。

恒河猴用于基本研究神经科学,行为生物学、生殖生理、内分泌学和心血管研究。

此外,由于其反应猴免疫缺陷病毒(SIV),恒河是公认最好的动物模型人类免疫缺陷病毒(HIV)感染。

它也是一个有价值的模型为研究其他人类传染性疾病和疫苗研究。

恒河猴基因组序列的可用性将促进这些领域的研究,使研究人员能够建立恒河基因的列表,以及之间的差异表恒河,黑猩猩和人类。

一组科学家已经组织了恒河的速度更详细的分析数据。

全球研究社区可以通过以下公共数据库和基因组序列数据观众:基因库和地图查看器在国家卫生研究院的国家生物技术信息中心(NCBI);EMBL的银行欧洲分子生物学实验室的核苷酸序列数据库;和DNA数据银行日本。

数据也可以透过UCSC基因组浏览器在加州大学圣克鲁斯分校和运用基因组浏览器在维尔康姆基金会桑格研究所在剑桥,英国。