研究人员证明了人类病原体“幽门螺杆菌”的适应性进化

的研究人员华盛顿大学医学院在圣路易斯罗氏系统已经发现了人类病原体幽门螺杆菌在对抗生素产生耐药性时的进化变化，根据一项在线发表在自然方法．

使幽门螺旋杆菌适应甲硝唑水平增加的突变很快在近12个连续适应的耐抗生素菌株中被发现。

幽门螺旋杆菌，最近在两名澳大利亚科学家因发现这种细菌而被授予诺贝尔奖后，出现在新闻中，与消化性溃疡疾病和胃癌有关。

为了精确定位突变，研究人员使用了NimbleGen开发的一种方法，称为比较基因组测序(CGS)，这种方法可以以近乎完美的精度在数百万个DNA碱基中发现一个单点变化。

在这项研究中，对幽门螺杆菌菌株的描述相当于对330万个DNA碱基进行测序，并确定了11个确认无误的突变。

“我渴望继续这些研究，观察幽门螺旋杆菌菌株适应进一步的抗生素压力，或适应炎症和其他防御反应，从而持续数十年的进化变化，”该项目的首席研究员、华盛顿大学医学院分子微生物学、遗传学和医学教授道格拉斯·伯格博士说。

“这种方法为我们提供了一个模型，用来理解在病原体进化、人类感染和疾病中很重要的适应性。”

CGS技术提供了比较整个微生物基因组的能力，以进行菌株鉴定，描述基因组变化对环境力的响应，并优化工业上重要的微生物。

它可以帮助追踪特定病原体在人类、动物或植物种群中的运动，并为微生物如何适应不同环境提供重要的见解——这些发现对公共卫生和流行病学、生物修复、工业发酵和生物合成菌株优化以及疫苗开发将越来越重要。

CGS依赖于NimbleGen高密度DNA微阵列的灵活性，该微阵列是定制设计的，用于研究整个微生物基因组，识别所有DNA变化，并完全表征所有snp。