揭示了“早熟”树突细胞在炎症反应中的作用

工作发表在《自然》杂志上,科学家们广泛的研究所和Fluidigm公司使用C1TM单细胞汽车准备系统准备细胞单细胞测序,使发现的一个族群的“早熟”细胞抗病毒基因表达早于大部分的树突细胞暴露于相同的抗原。通常,能够检测这些早熟的表达者的行动“细胞将失去由于平均在数以百万计的细胞大量细胞研究。

《自然》杂志发表的论文中还强调了角色的细胞异质性和它的重要性在免疫反应细胞间的沟通。研究了在典型的研究中,细胞在一个环境,使细胞和信号相互通信。然而,Fluidigm C1单细胞的汽车准备的独特属性系统允许研究人员从彼此孤立的细胞识别的特定细胞抗病毒基因表达。由于这些细胞被孤立,non-expressing细胞没有克服一个响应,表明细胞间通信中扮演着一个关键的角色在促进免疫反应。

除了罕见的细胞群的发现,这项研究代表了一个新的基准单细胞的大量数据。本文中的1774个细胞代表提供一个最大的单细胞基因组数据集出版日期和一个最大的信使rna序列数据集可用。

为了识别和描述这些罕见的“早熟”细胞,树突状细胞的数量,只占1%人员需要扩大高数量的细胞。要做到这一点,他们首先需要解决两个关键问题:如何准备为成千上万的细胞单细胞库,以及如何能上这样的大样本数据序列。

准备大量的单细胞库,研究者依赖于C1单细胞汽车准备系统,它刚刚被介绍到市场时这些实验开始了。C1系统的微流体技术使研究人员能够迅速、可靠地隔离,过程,和配置单个细胞进行基因分析。在研究过程中,该组织发现,他们可以实现稳定的数据与单个细胞在不到一百万读取率(相对于运行至少5 1000万读取进行批量信使rna序列时)。更快获得可靠数据的能力大大降低运行成本的实验。

纸”,单细胞RNA-seq揭示动态旁分泌细胞变异的控制“下面可以访问。