RNAi全球倡议成员在第二次会议上推进全基因组RNAi研究标准
由Dharmacon, Inc.和14个领先的国际研究中心组成的全基因组RNAi全球计划(RNAi Global)宣布了其基本目标的进展,即开发国际公认的标准,用于使用第一个完整的siRNA文库针对整个人类基因组的基因进行研究。
全基因组siRNA文库有可能从根本上改变生物学研究,加速药物发现和开发。
然而,以往技术的经验表明,实验室内部和实验室间的变化在一开始是常见的,并可能限制早期结果的最终效用。
今年4月在华盛顿举行的第二次RNAi全球会议上公布的初步数据表明,如果没有统一的标准,实验室之间的实验结果可能无法进行比较。
Fisher生物科学公司技术和业务发展副总裁William S. Marshall博士说:“为了加速产生有意义的实验输出,RNAi全球计划的12个成员在迄今为止最广泛的多位点比较RNAi筛选中使用相同的协议进行了相同的实验。”
“通过比较这个庞大的数据集,我们能够确定潜在变化的几个关键领域,以及实验室间实验比较所需的关键信息。”
“了解研究结果的这种内在差异是Dharmacon采取独特步骤的主要原因,即形成一个工作联盟,以开发必要的实验参数,以促进实验室间和实验室内的比较。”
德国癌症研究中心(DKFZ)的小组负责人Stefan Wiemann博士补充说:“20世纪90年代,微阵列新工具缺乏公认的研究标准,使生命科学研究界付出了多年的进展。”
“通过尽早解决对标准的需求,RNAi Global正在加速我们能够与全基因组siRNA文库合作的方式,这反过来有可能加速疾病和药物研究。”
每位成员进行的标准化RNAi筛选实验是去年10月RNAi全球第一次会议上讨论的标准提案的一部分。
来自成员机构的研究人员分析了联合筛选实验的结果,并在4月的会议上分享了他们的见解和观察,现在他们已经开始在一些科学会议上讨论拟议的研究方案的各个方面。
在收集了该领域其他专家的额外意见后,RNAi Global的代表计划在同行评议的期刊上发表拟议标准的草案。
“RNAi Global的成员已经在使用全基因组siRNA文库进行正在进行的研究,因此迅速制定标准是至关重要的,”Michael White博士说德克萨斯大学西南医学中心.
“当我们开始发表我们使用全基因组siRNA文库得出的发现时,它们在实验室内部和实验室之间具有可比性是至关重要的,RNAi Global的工作现在使我们能够朝着这个方向快速前进。”
“此外,RNAi Global内部关于全基因组筛查其他方面的公开讨论正在促进其他领域的专业知识交流,如分析开发、实验室自动化和统计分析。”
工作组第二次全体会议于4月5日至7日在华盛顿特区举行,会上分享了初步试点筛查活动的结果。
RNAi Global成员之间的这种持续互动有望帮助研究人员优化高通量人类全基因组siRNA筛选,并加速药物发现。