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RNA-Seq揭示感染相关性基因表达的变化疫霉capsici


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疫霉capsici是一种土著植物病原体感染的能力范围广泛的植物,包括许多茄属的作物。然而,遗传抗性和杀真菌剂常常无法管理p capsici由于知识有限,p . capsici致病性的分子生物学和基础。开始纠正这种情况,Illumina公司RNA-Seq是用于执行大规模并行测序的三个互补脱氧核糖核酸样本来自p capsici菌丝(我),延长(佐薇)和发芽囊肿,生殖管(GC)。1100万多个读取生成每个cDNA图书馆进行了分析。阅读后映射到p . capsici参考基因组的基因模型,13901年,14633年和14695年的基因被确定的读取,分别佐薇和GC库。两个样本之间的比较分析显示我的主要差异表达基因的内容,佐薇和GC阶段。大量与特定阶段和致病性相关的基因,包括98年的预测效应基因。19效应基因的转录水平在发展和宿主的感染阶段p capsici被rt - pcr验证。异位表达在烟草benthamiana表明p capsici RXLR和皱纹效应器可以抑制宿主细胞死亡引发的多样化包括细胞内p capsici elicitin和NLP效应器。这项研究提供了一个第一次看的转录组和效应器阿森纳p capsici pre-infection在重要阶段。

这篇文章是发表在PLos One,自由访问。

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