罗氏罗氏全息阵列使检测的基因紊乱导致糖尿病

染色体重组导致基因组疾病通常是由low-copy重复的基因组区域。罗氏罗氏全息阵列提供扩大探测覆盖在这些地区。使用这种技术,最近出版的一篇论文的作者发现复发性染色体的基因重排倒数区17 q12与先天性畸形胎儿样本,也与小儿肾脏疾病和癫痫。

结果强调的重要性评估新创结构变异事件在儿科疾病除了精神发育迟滞和重复的重要性架构作为疾病的诱发因素。

基因疾病源于非等位的同源重组(NAHR) low-copy重复区域的基因组和发生在大约1 1000年活产。这些已知的基因疾病的表型包括发育迟缓和精神发育迟滞。因此,小说基因筛查疾病主要集中在认知障碍患者和/或周围神经系统缺陷。

先前的研究报道BAC-based芯片的开发和使用针对130年“重排的热点地区,”定义为区域的基因组与架构暗示的敏感性microdeletion复发和/或重复。

使用这个数组,小说基因障碍与精神发育迟滞和发育迟缓(先生/ DD)被发现。令人惊讶的是,许多预测130个热点地区从未与拷贝数变异明显正常的个人或患者先生/ DD。

解决假设基因重组介导的许多这些地区影响基因通路以外的其他参与/ DD先生和扩大的光谱疾病引起的基因疾病,Mefford和同事分析了DNA样本产前解剖标本从155年与一个或多个胎儿先天性畸形,没有已知的细胞遗传学异常,详细的病理资料分析了BAC全息阵列。

数据显示,9个人(6%)显示的证据microdeletion microduplication和鉴定了其中的八个有潜在致病性删除或复制。精细定位使用自定义寡核苷酸阵列(罗氏,385 k,平均探针间距53 bp)透露,三个人港微小缺失与断点映射侧翼节段重复。

与双边但胎儿发育异常的肾脏包含1.8 Mb的删除地区17 q12,涉及19个已知基因。其中一个突变基因,TCF2,导致年轻的成年糖尿病类型5所示(MODY5)儿科和产前检测囊性肾脏疾病。

在一项研究中,三分之一的MODY5-affected个体表现出删除整个TCF2基因和周围的序列。

五小儿肾脏疾病没有糖尿病患者和患者三MODY5之前证明有删除包含TCF2基因进行了分析使用一个定制的寡核苷酸阵列(罗氏,385 k,平均探针间距53 bp)。

四个五个儿科和三个MODY5病人显示微小缺失几乎相同的胎儿的情况。

此外,罗氏罗氏定制fine-tiling全息阵列被用来识别互惠microduplication轻度到中度精神发育迟滞患者,癫痫,焦皮质发育不良。

总之,分析揭示了在一系列的微小缺失和重复与先天性畸形胎儿样本以外的精神发育迟滞。17 q12删除是第一个基因组障碍识别导致糖尿病和复发的鉴别microdeletion将产生重大影响的诊断,预后和管理肾脏疾病和早发性二型糖尿病的孩子。

因此,这个microdeletion的评价应考虑早期与肾脏病理诊断为儿童。

此外,作者提倡广义筛选基因组热点地区其他儿科疾病的父母和后代的遗传病因不清楚,包括精神分裂症、哮喘和心血管疾病。