科学家发射第一个人类口腔微生物的综合数据库

科学家们知道更多关于微生物的比以往任何时候都住在我们的嘴巴。他们知道,事实上,收集所有相关的信息在一个地方在设计实验本身可以是一个劳动密集型的工作。

现在,授权的国立牙科和颅面研究(NIDCR)的一部分美国国立卫生研究院的和他们的国际的同事打算解决这个问题,与此同时,博姿公司推出了第一个口腔微生物的综合数据库,或成为目前已知的大约600个不同的微生物生活在嘴里。

免费的在线纲要被称为人类口腔微生物数据库(HOMD)。数据库上线的数字相当于一本牛津词典口腔微生物,提供详细的生物的每一个物种,一个广泛的目录的条目的成千上万的这些微生物的基因表达。站点位于<http://www.homd.org>,是由科学家们福赛斯研究所在波士顿和伦敦国王学院在英格兰。

“HOMD填补了一个关键的研究需要,”NIDCR说劳伦斯•Tabak D.D.S.博士。“口腔微生物极其丰富的数据,HOMD成为科学家的基本搜索引擎查看和检索这些信息,生成新颖的假设,使计算发现,并最终开发更多生物声音控制口腔疾病的疗法。”

根据弗洛伊德Dewhirst D.D.S.博士。, a leader of the project and a scientist at The Forsyth Institute, HOMD also introduces the first comprehensive nomenclature system to bring order to the naming of uncultured or previously unnamed oral microbes. The standardized numbering system helps to eliminate the Babel of confusing names and uninformative database designations that have frustrated scientists and sometimes hindered their research.

数据库还分类每个微生物16 s rRNA序列,一种独特的指纹的遗传信息,科学家们利用过去二十年来识别微生物。这个序列信息允许微生物被放置在一个家族树显示它们如何彼此相关。对于那些生物的DNA测序,HOMD提供在线工具来查看和分析所有的基因和蛋白质。每个类别的信息在数据库中是相互关联的,容易搜索的,适当的注释,并将频繁更新保持电流。

Dewhirst说,尽管科学家HOMD已正式开放,数据库仍然是一个正在进行的项目。“我们已经组建了一个研究社区大量的有用的信息,但我们将继续扩大和完善数据库在接下来的几年里,“Dewhirst说。“我可以看到人类口腔微生物数据库作为一个有价值的其他微生物数据库模型在现在和未来。”

通常叫做“生物学的下一个革命,”所需微生物的研究打开了一个窗口到复杂的微生物群落,占据人体的大部分地区。bet188真人这些研究将定义如何维持健康的影响因素和微生物,当他们的社区动态摄动时,在常见慢性疾病中发挥作用,如蛀牙和牙周疾病。

2007年12月,国家卫生研究院启动了人类微生物组项目,最初将序列的所有基因,或基因组,600代表从口腔微生物群落微生物采样,皮肤、消化道,鼻子,女性尿道。bet188真人额外的研究正在进行或正在开发。

那些已经顺利进行是一个NIDCR-supported项目目录的编制一份完整的口腔微生物的基因组。它产生了大量的数据,再加上几十年的更传统的口腔细菌的研究,需要一个全面的、用户友好的数据库已经成为一个优先级。

“口腔微生物目前更好的理解比通过身体的其他部位,如肠,”布鲁斯帕斯特博士说,福赛斯理工学院博士,还和另一个项目的科学家。“由于口腔微生物出现在整个人体感染,医生HOMD数据库肯定会有用的。同样,工业微生物学家发现HOMD有用,因为有时口腔微生物污染食品或药品生产过程。”