SCIEX宣布OneOmics™的合作者

SCIEX宣布合作者在OneOmics™项目独家合作Illumina公司和SCIEX集成片™收购基于下一代蛋白质组学(NGP)和下一代测序(上天)数据BaseSpace®云计算环境。Advaita生物信息学、系统生物学研究所(ISB)和耶鲁大学的研究人员已经开发出基于云的应用程序和库,利用蛋白质组学数据狭长新颖的方式让研究人员分析和比较蛋白质组学和基因组学数据。这一努力进一步消除信息壁垒的OneOmics项目的目标之间存在不同的组学的学科。

副教授,罗布·莫里茨和他的团队从商学院图书馆开发SWATHAtlas离子发生器应用程序,允许快速和简化访问该校图书馆用于NGP试验片的收购。目前,该校举办离子库为人类,酵母和结核分枝杆菌(Mtb)蛋白质组。

莫里茨,在建立有影响力的合作伙伴说,“我们很高兴成为这个项目的一部分SCIEX Illumina公司。总的来说,我们的工具开发的特色和在更广泛的学术社区将提供一个强大的解决方案,将影响蛋白质组学的方法研究和系统生物学将在未来”。

从基因组学和蛋白质组学数据推导生物见解在生物信息学的前沿。领导人Advaita生物信息学发展的高通量生物数据分析解决方案,开发了iPathwayGuide应用,BaseSpace®平台。应用程序执行生化途径分析,基因本体分析,microrna的预测,药物和疾病蛋白质组学和狭长Illumina公司RNASeq数据的分析。找到真正的应用简化了过程从整合蛋白质组学和生物的见解转录组数据集,并将有助于推进生物标志物的发现和疾病研究。

克里斯·科朗格洛(蛋白质组学)博士和Rob厨房(基因组生物信息学)从耶鲁大学合作开发RNASeq翻译申请BaseSpace®平台,将一个Illumina公司RNASeq实验的输出转换为一种蛋白质数据库,可以用来创建离子库我SCIEX片采集数据。应用程序可以更有针对性的蛋白质组学分析方法的上下文中识别剪接变异,可至关重要的遗传学研究人员试图了解一个特定的疾病。这连环工作流系统生物学研究是一个常见的需求,但直到现在需要复杂的生物信息学的协议,除了少数的专业实验室。

“片收购使研究人员能够准确、量化地几千蛋白质在数以百计的样本,导致有意义的结论如何响应扰动”的蛋白质组变化,亚伦哈德逊说,学术和临床研究SCIEX业务高级总监。“下一个逻辑步骤是将这些蛋白质组与其他组学结果的结论,如基因组学和转录组。我们的合作者在商学院、耶鲁大学和Advaita生物信息学,都推出了免费的应用程序扩展工作流和提供通用的访问和标准化数据分析的两个最大的在生命科学领域。”

本月早些时候发布的,SCIEX片蛋白质组学云工具套件的应用程序是托管在Illumina公司BaseSpace®云计算环境中,创建一个位置基因组学和蛋白质组学“大数据”,使快速,安全,和简化分析的复杂multi-omics数据集。通过提供简化的信息在网络环境中,解决方案旨在帮助推进生物标志物的发现和开发新药物疾病如癌症、糖尿病、阿尔茨海默氏症和心脏病。