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序列是支架研究昏睡病


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研究人员做了一个进一步一步了解昏睡病——一种锥虫属寄生虫引起的慢性疾病,从而影响人类的中枢神经系统。团队产生一个高质量的基因组序列草案锥虫属的菌株,可见负责几乎所有报告病例的非洲人类锥虫病,也被称为昏睡病。

这项研究发表在开放获取期刊4月13日,《公共科学图书馆·被忽视的热带疾病。

t . brucei基因组序列之前用于研究从牛感染菌株,获得对人类无害。

团队的整个基因组测序致病性t . b . gambiense亚种和基因组序列与非人类感染相对,锥虫属brucei brucei。基因组都是亚种的t . brucei家庭。团队想要回答两个问题:现有的t . brucei brucei序列代表的多样性t brucei寄生虫?,有什么在t . b . gambiense基因组可能解释其感染的能力,在人类繁荣吗?

“历史上,昏睡病是严重被忽视的疾病,“马特·贝里曼博士说,寄生虫基因组学小组领袖维尔康姆基金会桑格研究所和作者的研究中,“有着相当大的影响人类健康和幸福和繁荣的社区。bet188真人

“推动研究,我们需要回答一个关键的问题:是t . b . brucei参考基因组序列合适的脚手架探索的基因组的多样性t brucei ?”

基因组比较扔了一个非凡的t . b . brucei之间的相似程度和t . b . gambiense——只是一个单一的轨迹是t . b . brucei独有。此外,类似的基因的序列,平均有98.2%相同。由于基因组是如此相似,团队可以满怀信心地说,t . b . brucei寄生虫及其基因组好的模型对未来实验来了解t . b . gambiense的生物学。

两个基因组之间的相似性也建议的来源t . b . gambiense感染人类无法解释的能力仅仅通过添加或删除一些基因。

“我们看的两个序列非常相似,”安德鲁·杰克逊博士说,从维尔康姆基金会桑格研究所和作者的研究中,“没有明显的遗传原因t . b . gambiense之间的差异和t . b . brucei。表型的变化——物理特性——似乎更微妙的遗传信息的改变。

“单字母基因组的变化;差异基因的拷贝数;基因的活动是如何监管的变化,所有这些基因的细微差别可以发挥至关重要的作用在决定为什么t . b . t . b . brucei gambiense表现如此不同。”

有了两个高质量的参考基因组序列t . brucei菌株,寻找那些小遗传差异是给定一个提振。正是由于这种搜索将燃料的追求解决t . b . gambiense靶向药物治疗。

病人治疗通常非常谨慎,因为目前的治疗的副作用可以不愉快,有时严重。我们知道不同的锥虫属亚种易受不同的药物和基因序列可以帮助寻找新的地区的寄生虫对哪些药物可能有针对性的分子组成。

研究也比以往更详细地看着寄生虫的进化的复杂系统来欺骗人类和动物的免疫系统。

锥具备一套非常有效的蛋白质——vsg——住在细胞的表面,可以形成一种隐形斗篷保护寄生虫的免疫反应。先后激活这个大蛋白家族的成员,这些寄生虫可以保持领先一步的宿主免疫系统,因此未被发现在人类血液中茁壮成长。

“vsg的军械库寄生虫的处理意味着它可以保持领先一步,”克里斯蒂Hertz-Fowler博士解释说,桑格研究所和该研究的资深作者。“因为他们的角色,vsg寄生虫基因组中最迅速发展的基因。我们惊奇地发现,多达88%的vsg t . b . brucei之间保持一致和t . b . gambiense基因组。这对将来的流行病学研究。

“它意味着研究者可以产生全球图书馆vsg t . brucei菌株,使他们对t . brucei菌株进行分类的字段显示的精确设置中找到vsg他们拥有。”

这个目录的vsg人类传染性也可能提供进一步的线索。研究团体现在可以窥视基因在细胞表面的构成——最好的地方去寻找那些细微的差别,使t . b . gambiense感染人类。
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