SGI帮助国家解决要求生物研究的问题的解决方案

硅谷图形和SCICOR授权SGI解决方案提供商已经宣布国家癌症研究所的高级生物医学计算中心(ABCC马里兰州弗雷德里克),从SCICOR购买范围广泛的SGI®高性能计算、可视化和数据存储解决方案,帮助解决一些最苛刻的生物研究的问题,包括生物信息学、蛋白质组学、成像、计算生物学和化学。

ABCC支持国家癌症研究所(NCI)和美国国立卫生研究院的(国家卫生研究院)在破译人类基因组等领域的研究,了解生物分子的结构关系,为多种疾病和治疗学的发展,特别是艾滋病和癌症。

国家癌症研究所的科学家们,国家卫生研究院和市外的生物医学研究人员现在可以匹配他们的特定的问题需要适当的SGI硬件平台。

ABCC如此多样性的SGI系统允许将应用程序配置为适当的机器的效用和效率。

“NCI的超级计算中心是一个世界级的分子生物学家,生物信息学资源提供一个完整的计算工具的生物研究问题,从一级序列确定的分子建模和基因连锁分析,”弗兰克·迈耶说,SCICOR总统。

“SGI的高性能计算的结合,先进的可视化和数据存储解决方案将被证明是一个无价的和集成的资源来执行不同的任务非常复杂的研究。”

“这些SGI的解决方案表示动态分析环境旨在解决一些最计算密集型生物医学研究的问题和提供的突破,NCI科学家多年来一直致力于。”

数据库的戏剧性增长迫使ABCC解决日益复杂的用户查询,这需要额外的处理器能力,内存和数据存储容量。

为了解决这些日益增长的需求,ABCC已经购买了一个SGI®Altix®3700超级计算机,由256英特尔®Itanium®2处理器并运行开源的Linux®操作系统,这将作为一个重要的科学计算资源,是越来越多的SGI的一部分服务器中心。

ABCC研究者依赖于Altix系统的可伸缩性和他们的能力来处理大内存的问题,比如建模抗癌药物的相互作用与已知肿瘤目标或基因/蛋白质组学数据分析。

增加它的数据存储容量,ABCC购买了50个结核病SGI®InfiniteStorage总业绩9700 (TP9700) RAID存储阵列、光纤通道存储阵列配备4 gb /秒接口、操作和SGI®InfiniteStorage cxf™共享文件系统和SGI®InfiniteStorage数据迁移工具(DMF)。

ABCC已经使用cxf共享数据在存储区域网络,增强工作流和降低成本通过消除文件复制和所花费的时间通过网络把大文件。

操纵越来越大的DNA序列,并设置在ABCC DNA序列是一个日益增长的需求。

加强可视化功能数据分析至关重要,ABCC将现有的64处理器SGI Altix服务器转换成64处理器硅谷图形棱镜™。

借助现有的硅谷图形棱镜可视化系统,ABCC最近赢得了“最佳实践知识管理奖”从看到你的世界。

ABCC硅谷图形棱镜可视化系统加速显微镜科学家的效率和工作流程,提供有效的分析大型数据集,并呈现结果NCI提供的几个测试用例显微镜样品进行评估。

在软件可视化方面,ABCC使用MineSet™执行基因组序列的比较。

1999年引入的SGI MineSet是一套强大的可视化数据挖掘和数据可视化软件工具。

它提炼出了复杂的信息访问和容易理解交互式3 d实时图形来帮助用户快速识别趋势和模式的数据。

紫色的洞察力已授权开发、支持和分销权从SGI MineSet。

ABCC也购买了SGI®®现实中心,一个身临其境的可视化环境适合跨职能团队类似NCI和NIH需要合作,使项目团队采取多学科的方法,他们的生物医学研究。

现实中心被选为其高性能图形和立体可视化功能,这将允许一个高水平的交互性和非常大的视觉数据集,如大分子,将增强的速度cross-collaborative科学团队间的决策过程。