短RNA分子在单细胞映射

卡罗林斯卡医学院及路德维希癌症研究所的研究人员测量的绝对数字短,非编码RNA序列在人胚胎干细胞。新方法可以改善我们的基因是如何监管的理解和不同的细胞类型发展。

当使用在我们的基因信息,例如建立一种蛋白质,它是第一个翻译信使rna功能蛋白质的蓝图。我们的细胞也含有非编码,短,RNA序列,不会导致蛋白质的形成,其功能是部分未知。其中最著名的是微RNA (microrna),可以与信使RNA相互作用,从而调节基因和细胞的功能。

卡罗林斯卡医学院的研究人员绘制了短rna序列在单个细胞的存在。先前的研究在短RNA分子同时是许多细胞分析的基础上,很难研究精确的函数。

“我们的知识短RNA分子的功能很一般。我们有一个图片的一般机制,但目前还不太清楚这些分子扮演特定角色的不同类型的细胞或疾病,”理查德桑德伯格说,细胞和分子生物学系教授,也是隶属于斯德哥尔摩的路德维希癌症研究。

两种类型的胚胎干细胞

使用单细胞转录组分析完成,这一技术可以测量短RNA分子的绝对数量在一个细胞。两种类型的胚胎干细胞被使用,旨在模拟早期胚胎,之前和之后附着在子宫内膜。

研究人员可以发现大量的小分子RNA在细胞状态,包括microrna以及短RNA片段(tRNA和snoRNA)的功能在很大程度上是未知的。研究人员还发现,大量的microrna表达不同的两个细胞状态。

“这是基础研究和证明方法,为进一步的研究提供建议。映射短RNA分子在细胞的水平的第一步是识别这些分子的特定功能,“Omid Faridani说,这项研究的主要作者之一。

从长远来看,理查德桑德伯格可以想象该方法的临床应用。

例如,“我们感兴趣的短RNA分子在胚胎发育中起到的作用。我们希望,有更多的知识,这种方法可以用来确定哪些胚胎有最好的发展机会,这将被用来改善目前的试管受精治疗,”他说。

来源:

发生的故事卡罗林斯卡医学院及路德维希癌症研究。请注意:上面的内容可能是编辑,以确保其符合技术网络的风格和长度的指导方针。188金宝搏备用

参考:

Faridani, o . R。阿,我。Hagemann-Jensen, M。席尔,j . P。兰纳,F。&桑德伯格,r (2016)。单细胞测序的小rna转录组。自然生物技术。doi:10.1038 / nbt.3701