四川农业大学和LC科学发现肥胖的表观遗传学
在一项新的研究发表在自然通讯,来自四川农业大学的研究人员和LC科学报告的miRNAome猪脂肪和肌肉组织。
报告提供了一个宝贵的外遗传性肥胖来源发展的预测和预防,促进猪作为人类肥胖研究的模式生物。
科学家们现在知道遗传密码孤独不是负责成人表型,甚至这些成年人的后代。
表观遗传学是指基因表达影响表型的变化,不涉及改变DNA核苷酸序列本身,而且是可遗传的。
DNA甲基化、组蛋白修饰和微rna (microRNA)表达式的例子表观遗传机制,最近被确认为重要的监管机构在许多生物系统基因表达。
全球肥胖是一个巨大的问题。最近,世界卫生组织报告说,肥胖水平翻了一番在世界每个地区在1980年和2008年之间,刺激的非传染性疾病,如糖尿病和癌症,现在几乎占全球三分之二的死亡。
它变得明显,表观遗传因素,如DNA甲基化和microrna的表达,在肥胖的发展有重要作用。
现在,研究所的研究员领导的研究小组动物遗传和育种,四川农业大学,中国已使用猪模型调查系统的表观遗传监管者和肥胖之间的联系。
猪是一个很好的模型系统研究肥胖由于他们相似的生理的包括:代谢功能、心血管系统、成比例的器官大小。
研究人员生成的全基因组DNA甲基化地图microrna的表达以及基因表达地图对脂肪和肌肉组织生活在类似的环境,但从三个猪品种显示不同的脂肪水平。
microrna的表达这个项目的一部分是由团队成员从LC科学的杭州,中国实验室。LC科学专家microrna的测序和表达分析和曾与来自四川农业大学。
2010年他们进行一个全面的寻找猪microrna,延长了的猪miRNAome 777独特的microrna并使地图册microrna的监管功能和网络建设,为未来的microrna的研究在猪模型奠定了基础。
其他与该集团的合作包括调查的microrna的表达猪性腺和人类母乳。LC科学已在中国与其它农业团体的工作,包括:华中、扬州和南京大学猪microrna的研究。
在当前的研究中,许多microrna在肥胖是已知的或潜在的角色。此外,研究人员发现,男性与女性的差异甲基化区域。这个地区位于启动子的microrna的集群,包括相邻mir - 99 b, let-7e和mir - 125 a。
虽然没有之前的证据存在这三个microrna与肥胖有直接关系,这些microrna的关键功能和目标可能导致肥胖发展的性别差异。
LC科学业务负责人Qiulei朗博士在亚洲说,“microrna的自2005年以来一直专注LC科学的。那时我们才意识到它的重要性,所以定制的功能,以支持农业全球客户的microrna的研究。专有RNA-Seq数据分析管道是由LC科学使我们理解我们生成大量的小RNA序列数据在这项研究。”
数据分析显示全球表观遗传相似性和品种之间的差异,性别和解剖位置。epigenetically监管区域通过表达启动子的高度与肥胖相关的开发镇压的已知基因与肥胖相关的基因和小说。这个全面的地图提供了一个坚实的基础为探索肥胖的表观遗传机制。
明州李来自四川农业大学博士说,“国内猪是巨大的农业意义和为人类肥胖的研究提供了有价值的模型。最近,表观遗传因素,特别是DNA甲基化和microrna的规定获得了更大的升值作为替代视角复杂疾病的病因学。虽然对转录开始网站的主要microrna的成绩单,我们的研究结果表明,DNA甲基化在5 '茎环结构前体的上游有成熟的microrna的转录沉默的角色。”
在现代工业、猪发生了强烈的基因选择在相对天生的商业行瘦肉产量,或在某些情况下,脂肪生产,导致显著的表型和遗传适应变化,使这些品种行一个完美的模型比较研究。
从北京大学首席研究员Ruiqiang李说,“这项工作将作为一种宝贵的资源为未来的功能验证,促进进一步发展猪作为人类肥胖研究的模式生物,以及经济效益最大化生产高质量的猪肉。”