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SIGLa:一个适应性强的LIMS多个实验室


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背景
需要管理大量数据是一个明确的对实验室的需求。使用实验室信息管理系统(LIMS)来实现这一增长每一天。LIMS是一个复杂的计算系统用于管理实验室数据质量保证的重点。目前有几种LIMS。然而,大多数的专有代码和商业化的高成本。此外,由于其复杂性,LIMS通常设计符合需求的一种实验室,使其很难重用LIMS。在这个工作我们描述Sistema Integrado de Gerencia de laboratorio (SIGLa),一个开源LIMS的新方法,旨在使它适应各种类型的实验室的活动和过程。

结果
SIGLa集成了一个工作流管理系统,从而能够创建和管理定制的工作流。为每个新实验室工作流定义的活动,规则和程序。执行期间,对于每个工作流创建,XPDL文件中定义的值的属性(描述工作流)存储在SIGLa的数据库,然后允许管理和检索。这些特征增加系统的灵活性和可用性推广到包括多种类型的实验室的需求。构建SIGLa工作流的主要功能蛋白质组学实验室的最初定义。验证SIGLa能力适应实验室的倍数,在本文我们研究过程和微阵列实验的需求并定义其工作流。这个工作流定义在大约两周后,显示该工具的效率和灵活性。

结论
使用SIGLa有可能在几天内构造一个微阵列LIMS说明方法的灵活性和强大功能。SIGLa的发展我们希望贡献积极的面积管理复杂数据在实验室的管理大量的数据,保证数据的一致性,提高实验室的工作效率。我们也希望成为可能与小资源承受高水平实验室为复杂的数据管理系统。

这篇文章是发表在《BMC基因组学和自由访问。

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