Solexa和合作的科学家揭示了转录组的小RNA成分

Solexa, Inc.宣布，其研究人员与特拉华生物技术研究所和特拉华大学合作，报告了迄今为止对转录组小RNA成分的全面分析。

这项名为“转录组中小RNA成分的解析”的研究发表在2005年9月2日的同行评议期刊《科学》上。

Solexa的检测方法可用于阐明任何植物或动物物种的小rna，尤其是人类。

Solexa的首席执行官John West说:“发现小rna在不同的生物体中组成了一组有效的调控分子是过去10年最重要的发现之一。”

“这项研究在全基因组范围内表征这些重要调控分子的能力方面是开创性的。”

Solexa公司声称，其技术的优势在于可以准确、可重复和定量地读出全部激活基因和小rna，包括低水平表达的基因，而不需要预先了解感兴趣的基因或序列。

该公司还打算开发这种小RNA检测方法，用于其下一代测序平台，该平台计划于今年年底推向市场。

利用Solexa的高通量测序技术，该研究在拟南芥植物中鉴定出超过77,000个小rna，比之前已知的多10倍。

这项研究生成了200万个短DNA序列，称为签名序列或序列标签，以识别和量化已知和新的小RNA分子。

拟南芥基因组中许多以前被认为不活跃或无特征的区域被发现是具有相当小RNA活性的位点。

该研究的资深作者、特拉华大学助理教授布莱克·迈耶斯(Blake Meyers)说:“签名测序方法使研究不同生物体中小RNA群体的整体身份、调节和功能成为可能。”

“这些广泛的小RNA数据将帮助生物学家了解小RNA及其调控。”

“我们还发布了一个增强版的拟南芥MPSS网站，以进一步促进公众访问和使用这些数据。”

“这些实验强调了研究整个基因组以寻找小RNA活性证据的重要性，”该研究的另一位资深作者、特拉华大学和特拉华生物技术研究所的教授帕梅拉·j·格林(Pamela J. Green)说。

“新发现的与基因匹配的小rna令人兴奋，但那些来自基因之间相对无特征区域的小rna也令人兴奋。”