一些传统毕竟长非编码rna

不久前科学家认为rna进来两种类型:编码rna,蛋白质和非编码rna结构角色。接着小rna的发现,开辟了全新的研究领域。现在研究人员回到了原点,并预测,一些长非编码rna能增加小生物功能的蛋白质。

“我们已经确定了数以百计的开放阅读框架长非编码rna的人类和斑马鱼可以引起功能使用核糖体蛋白质分析,“安东尼奥·吉拉尔德茨说,这项研究的主要作者之一,耶鲁大学医学院的教授在美国。

核糖体分析允许科学家测量多少RNA翻译成蛋白质。信使RNA片段的方法允许直接量化核糖体与酶核酸酶消化后的保护。核酸酶破坏暴露核苷酸之间的债券构成RNA和不受核糖体蛋白质合成器的保护。留下的是一个可衡量的RNA注定要产生蛋白质。

研究人员能够可视化翻译和核糖体的运动每三核苷酸,对应于每个密码子的大小在RNA产生一种氨基酸。这是可能通过结合核糖体的高分辨率分析的生物信息学工具开发的叫做ORFScore吉拉尔德茨的实验室。

“我们的研究是并行的关键使用第二个计算方法,依赖于生物信息学工具称为micPDP,”吉拉尔德茨说。“micPDP透露,核糖体rna被分析对应于肽已保存在进化的过程中。这强烈表明,这些基因编码的蛋白质有特定的功能在这些动物。”

进一步验证其方法,科学家们迈出第一步,用质谱检测和描述近100肽编码的rna。

直到最近,长非编码rna被认为是限制越平凡但重要的结构性的角色,支持细胞的功能至关重要。“我们认为这些小功能肽的主要原因已经错过了早期的研究是由于假设分配函数时需要做大量的基因,”尼古拉斯Rajewsky EMBO成员说,Max-Delbruck-Center教授在柏林,德国柏林医学系统生物学研究所的主任和团队贡献的主要作者之一micPDP计算方法确定守恒micropeptides。“短开放阅读框架是如此众多,设计标准的基因组注释方法必须过滤掉短开放阅读框架。”

有许多短肽的性质,例如神经肽或胰岛素,但与小肽因长非编码rna他们生产大preproteins需要削减他们的最终大小。第一个报告的活动产生的小肽长非编码rna已经开始出现。Schier和他的同事们最近发表在《自然》杂志网站上发表了他们的小肽,作为一个信号促进细胞运动性鱼早期胚胎。名为蹒跚学步的蛋白质来自长非编码rna和作为激活G蛋白耦合的受体,细胞中的其中一个重要的信号分子。早期的研究表明,长非编码RNA由tarsal-less /精米mille-pattes基因编码的小肽控制上皮形态发生在果蝇和面粉甲虫种有害。

翻译“我们识别数以百计的小型开放阅读框架大大扩展了组micropeptide-encoding脊椎动物基因提供一个入口点,调查他们的现实生活功能,”吉拉尔德茨说。

“肽预测报告在这些研究是诱人的,但这只是第一步。事情应该很有趣的社区探索预测的功能肽在体内,”斯蒂芬·m·科恩说,分子和细胞生物学研究所的教授在新加坡不是该论文的作者之一。“我想,我们会听到很多关于这个新肽世界在未来几年”。